原核微藻psbA基因的密码子偏好性及聚类分析

发布时间：2017-11-05 00:04

  本文关键词：原核微藻psbA基因的密码子偏好性及聚类分析

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【摘要】：D1蛋白是光合作用反应中心的一种蛋白,研究编码该蛋白的psb A基因密码子的偏好性及聚类分析对原核微藻的分类具有重要意义。本研究利用MEGA和Codon W软件分析psb A基因的碱基组成和密码子适应指数、有效密码子数及相对密码子使用度等参数。结果表明,不同种属原核微藻的psb A基因具有明显的密码子偏好性,且密码子使用模式多样,可反映该类群生物种属之间的亲缘关系。依据密码子偏好性的欧式平方距离系数进行聚类,证实密码子的偏好性与其物种的亲缘关系及进化存在一定的关系,其聚类结果可作为系统发育分析的重要补充。
【作者单位】： 天津商业大学生物技术与食品科学学院/天津市食品生物技术重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(31270050) 创新团队项目(140028)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 原核微藻是光合自养微生物的统称,其中有些种类是生产食品的原料;有些种类富含生物活性物质,可应用于医药领域或作为食品添加剂应用于功能食品开发。然而由于原核微藻个体微小、形态简单,基于形态特征的分类系统不能很好反映它们之间的亲缘关系,也无法满足新分离藻株的鉴定需

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本文编号：1141700