中粒咖啡萜类合成酶基因家族的生物信息学分析

发布时间：2017-11-07 20:07

  本文关键词：中粒咖啡萜类合成酶基因家族的生物信息学分析

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【摘要】：萜类化合物具有重要的生理、生态作用和药用价值,萜类合成酶(TPS)是合成萜类化合物的关键酶。通过整合中粒咖啡(Coffee canephora)的基因组和转录组数据,利用生物信息学方法,鉴定出43个萜类合成酶全长基因,并对这些基因的分子进化、结构、复制、表达及功能分化的机理进行了探究。结果表明,中粒咖啡萜类合成酶基因可以分为5个亚家族(a、b、c、e/f、g),不同亚家族的基因结构差异很大;串联复制是基因家族扩增的主要原因;表达分析结果表明,萜类合成酶基因在不同组织中的表达差异明显;中粒咖啡萜类合成酶基因启动子区的顺式调控元件可能与基因的功能分化相关;不同亚家族之间的功能差异主要由亚家族特异的氨基酸决定。
【作者单位】： 陕西师范大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金(No.31370329) 中央高校基本科研业务费(No.GK201403004)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 程甜,魏强,李广林(2016).中粒咖啡萜类合成酶基因家族的生物信息学分析.植物学报51,235 250.萜类化合物(terpenoid)是植物代谢产物中种类最多、结构最为复杂的天然产物,根据组成萜类化合物的异戊二烯(isoprene,C5)单元数的不同,萜类化合物可分为单萜(monoterpene,C10)、倍半

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1 黄燕;王一凡;兰芹英;;咖啡属不同品种脱水耐性的研究[A];第二届全国种子科学与技术学术研讨会论文摘要集[C];2011年

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本文编号：1153911