绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测

发布时间：2017-11-07 21:09

  本文关键词：绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测

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【摘要】：本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9(Growth differentiation factor 9,GDF9)基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系。首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性。结果显示,克隆获得GDF9基因mRNA全长1 852bp(GenBank序列号:KR063137),编码区两侧翼分别具有5′-UTR58bp(1~58nt)和3′-UTR 432bp(1 421~1 852nt)。进一步克隆获得长为2 898bp的DNA序列和2 304bp的调控区序列,分析发现调控区序列比数据库序列(NC_019462.1)多两个长片段。序列比对发现了已知突变G260A(G1)和调控区新突变-2078CG。分型结果显示,11个绵羊品种均不含FecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突变,而G260A和-2078CG广泛存在于除草原型藏羊外的各绵羊品种中,G260A表现3种基因型(AA、BB和AB),首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中检测到BB型突变纯合子。-2078CG也存在3种基因型,基因型结果表明该位点与G260A完全连锁。关联分析结果显示,小尾寒羊AB型产羔数显著高于AA型(P0.05)。本研究完善了绵羊GDF9mRNA、DNA和调控区全长序列,为进一步研究GDF9基因功能奠定了基础。同时在不同绵羊品种中发现了G260A和-2078CG突变,其中G260A作为潜在的有效遗传标记可用于提高绵羊的产羔数。
【作者单位】： 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与种质创新重点实验室;
【基金】：中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS13) 国家肉羊产业技术体系专项(CARS-39) 国家自然科学基金项目(31472078) 国家转基因科技重大专项(2016ZX08009-003-006,2016ZX08010-005-003) 内蒙古自治区战略性新兴产业发展专项资金计划
【分类号】：S826
【正文快照】： 产羔数是绵羊最重要的繁殖性状。作为转化生长因子β超家族的一员,GDF9(Growth differentia-tion factor 9)通过旁分泌方式对卵泡的生长和分化起着重要作用[1-6],并在提高绵羊产羔数中扮演着重要角色。绵羊GDF9基因位于5号染色体[7],其包含2个外显子和1个内含子,编码456个氨基

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本文编号：1154123