牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息学分析

发布时间：2017-11-08 08:03

  本文关键词：牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息学分析

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【摘要】：试验旨在对牛MARK2、CREB5基因进行克隆和生物信息学分析。首先在GenBank数据库中利用人MARK2和CREB5基因序列比对获得牛的表达序列标签(ESTs)的序列,进行引物设计并利用RT-PCR方法从牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,补足空缺部分,最终获得牛MARK2和CREB5基因。通过对牛MARK2和CREB5基因的生物学特性进行分析可知:牛MARK2基因的编码区长为2 076bp,编码691个氨基酸,CREB5基因的编码区长1 527bp,编码508个氨基酸;经蛋白质理化性质预测MARK2和CREB5蛋白均为亲水性蛋白;MARK2和CREB5蛋白的磷酸化位点均分布于苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)和酪氨酸(Tyr)残基上;MARK2蛋白与CREB5蛋白的二级结构预测以无规则卷曲为主;亚细胞定位预测MARK2蛋白主要分布在细胞质中,CREB5蛋白主要分布在细胞核中,两者均不属于分泌型蛋白;MARK2蛋白保守结构域预测含1个S_TKc和1个UBA功能结构域,CREB5蛋白保守结构域预测含有1个ZnF_C2H2、1个BRLZ功能结构域和5个低复杂度区域且二者均不具有跨膜结构。
【作者单位】： 天津农学院动物科学与动物医学学院;
【基金】：国家转基因重大专项:高产转基因肉牛新品种培育(2014ZX08007—002)
【分类号】：Q78
【正文快照】： 牛肉作为高营养价值的保健型肉食品,具有高蛋白、低脂肪、低胆固醇等特点,越来越受到人们的关注[1]。牛肉品质受肌内脂肪含量、脂肪酸组成、大理石纹、嫩度、pH、肉色及风味等因素的影响,而牛的健康状况又直接决定着牛肉的肉品质,研究表明利用遗传育种方法改善牛肉品质切实可

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本文编号：1156275