民猪FoxN1基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-11-10 09:21

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【摘要】：试验旨在对民猪FoxN1基因的结构和功能进行初步探索。利用常规PCR技术对民猪FoxN1基因进行克隆,利用生物信息学手段对所获得FoxN1基因完整编码区序列进行分析,对民猪和大白猪的FoxN1基因序列进行比对,并构建分子进化树。结果显示,民猪FoxN1基因完整编码区长1 941bp,编码646个氨基酸,分子质量为68.64ku,理论等电点为5.81。FoxN1蛋白位于细胞核内,不存在信号肽,不是分泌性蛋白,不存在跨膜区,在第269—347氨基酸处有1个叉头结构域,该蛋白在不同的物种间有高度的保守性。克隆发现了3种转录剪切变异体,与变异体1相比,变异体2在第124—387核苷酸位置处发生缺失,变异体3在581—582处发生GCA插入。民猪与大白猪的FoxN1基因序列相比,存在4个突变位点,其中3个是同义突变,1个是错义突变,导致第108位的氨基酸发生了改变。由分子进化树得知,民猪与偶蹄目动物亲缘关系较近。上述结果表明FoxN1基因结构复杂,对其生物信息特性的探究将为进一步揭示民猪FoxN1基因的功能提供依据。
【作者单位】： 东北农业大学动物科技学院;黑龙江省农业科学院畜牧研究所;
【基金】：国家自然科学基金项目(31301955) 黑龙江省自然科学基金项目(C201312) 国家生猪产业体系岗位科学家(CARS-36)
【分类号】：S828
【正文快照】： Forkhead转录因子家族是一组翼状螺旋/叉头型转录因子家族,包含一个特有的Forkhead DNA结合域。在人类已发现20多种Forkhead基因,其在胚胎发育特别是在内胚层发育、内胚层来源的器官形成中发挥关键性的调控作用。叉头蛋白N1(Forkhead box protein N1,FoxN1)是Forkhead转录因子

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