丹参miR408基因前体序列的克隆及表达分析

发布时间：2017-11-12 18:06

  本文关键词：丹参miR408基因前体序列的克隆及表达分析

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【摘要】：MiR408是植物中一类高度保守的miRNA,其靶基因编码含铜蛋白,miR408的表达受植物生长发育和环境条件的显著影响。拟南芥中miR408在HY5-SPL7基因网络中起着关键作用,而HY5-SPL7基因网络可介导拟南芥对光照和铜离子的协调应答,进一步表明miR408在植物对环境的响应中发挥了核心作用。本研究基于丹参基因组Survey数据库,从中搜索并克隆得到366 bp的含有稳定茎环结构的miR408前体序列及其上游723 bp片段的启动子区,Gen Bank登录号分别为KU360384和KU360385,并将miR408的前体序列命名为SmMIR408。生物信息学分析结果显示:Sm-MIR408上游启动子序列与模式植物拟南芥Ath-MIR408、水稻OsaMIR408启动子区具有许多相同的顺式作用元件,如G-box、CGTCA-motif、TGACG-motif、GTAC-motif等,而HSE、CATT-motif作用元件仅存在于丹参启动子区;miR408成熟序列在不同物种中具有很高的保守性;基于不同物种miR408前体序列构建的系统进化树显示,来源于单子叶植物的miR408前体序列聚为一支,来源于双子叶植物的miR408前体序列聚为另一支。实时定量PCR分析结果显示:Sm-MIR408在丹参的根、茎、叶、花中都有表达,其在花中的表达量最高,根中最低;Sm-MIR408的表达受茉莉酸甲酯和伤害的抑制,黑暗和持续光照也可抑制该基因的表达。Sm-MIR408基因的克隆与表达分析为今后研究丹参miR408的功能奠定了基础。
【作者单位】： 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室陕西师范大学;
【基金】：陕西省自然科学基金项目(2014JQ3107) 中央高校基本科研业务费专项资金项目(GK201302043) 陕西师范大学勤助科研创新基金项目(KY2015ZD05)~~
【分类号】：S567.53
【正文快照】： This work was funded by grants from the Natural Science Foundation of Shaanxi Province(2014JQ3107),Fundament ResearchFunds for the Central Universities(GK201302043),and Shaanxi Normal University Work-Study Program For Scientific Research In-novation Fund，

本文编号：1176994