油棕等热带植物DXS基因的生物信息学分析

发布时间：2017-11-17 23:10

  本文关键词：油棕等热带植物DXS基因的生物信息学分析

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【摘要】：油棕等热带植物含有丰富的胡萝卜素和维生素E等类异戊二烯物质,类胡萝卜素和甾醇等类异戊二烯物质在植物生命活动中扮演重要角色,并且对保护人类健康具有重要意义,MEP途径是合成类异戊二烯的重要途径之一。DXS是MEP途径中的第一个限速酶,其功能在油棕等热带植物中极其保守。为了弄清油棕等热带植物DXS的结构和功能特点,该研究利用生物信息学工具和软件对以油棕等热带植物类异戊二烯合成关键基因DXS为对象,进行核酸和氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构以及功能结构域等分析,探讨了不同物种间的亲缘关系。结果表明:DXS基因起始密码子均为ATG,终止密码子则分为TAG、TAA和TGA,DXS蛋白质属于不具有信号肽的亲水性蛋白,可能作为转运蛋白在叶绿体基质中发挥作用,未发现明显的跨膜结构域,磷酸化位点有36个,其中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点分别为17、11和8个,无规则卷曲和α-螺旋是蛋白质二级结构主要的结构元件,三级结构预测具有DXS酶特征,硫胺素焦磷酸盐结合位点和PLN02582保守结构域,不同植物DXS功能结构域非常保守,可以作为判断不同物种间亲缘关系的重要依据。该研究结果为油棕等热带植物DXS的结构、功能分析和利用提供了进一步的信息,为其品质性状分子机制研究及遗传改良奠定了基础。
【作者单位】： 中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室;
【基金】：国家林业局“948”项目(No.2013-4-40)~~
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 油棕(Elaeis guineensis Jacq.)属棕榈科多年生乔木,是热带产油植物,果实中类胡萝卜素的含量是决定油棕品质的一个重要指标。粗棕榈油中含有600 mg·kg-1类胡萝卜素,其中80%都是β-胡萝卜素和α-胡萝卜素,这也是粗棕榈油呈黄色或红棕色的原因(雷新涛和曹红星,2013)。巴西橡胶

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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【相似文献】

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本文编号：1197686