红花转录物组中筛选的Unigene100791基因克

发布时间：2017-11-23 04:13

  本文关键词：红花转录物组中筛选的Unigene100791基因克隆、生物信息学分析及功能预测

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【摘要】：目的:克隆红花Unigene100791基因,研究其表达情况;并对该基因的特性进行生物信息学分析,为后续红花代谢调控及提高红花油产量,使其满足食品工业市场需求奠定理论基础。方法:从红花转录物组数据库中筛选得到转录因子Dof相关基因Unigene100791的中间片段;利用RNAiso plus试剂法提取红花种子总RNA,利用RT-PCR方法反转录得到红花种子c DNA;采用3'Race方法从红花种子中克隆Unigene100791基因的全长序列;通过生物信息学方法对其全长基因进行分析,构建该基因与相关物种的系统进化树,研究其蛋白序列的同源性及其理化性质与结构特征,预测其生物学功能。结果:成功克隆了红花Unigene100791基因,其基因全长1274 bp;开放阅读框981 bp,编码326个氨基酸,理论分子质量约为35026.5 u,理论等电点9.5,带正电残基27个,带负电残基18个,序列含有典型的加尾信号poly(A);红花Unigene100791基因编码产物与烟草Dof2.4-1亲缘关系较近,属于Dof超家族,此蛋白存在信号肽,不存在跨膜结构。结论:成功克隆了红花Unigene100791基因,并对其编码的蛋白质进行了生物信息学分析。
【作者单位】： 长春师范大学生命科学学院;吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心;
【分类号】：TS201.3
【正文快照】： 转录因子,亦称为反式作用因子,是参与真核细胞转录调控的一类细胞核内蛋白质因子。转录因子能够与真核基因启动子区域中的顺式作用元件发生特异性相互作用来调节转录的活性[1],在基因表达的转录水平上起着关键作用。转录因子广泛的存在于动植物体中,尤其是在植物的生长发育过

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1 陆志城;你方唱罢我登场[N];医药经济报;2002年

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本文编号：1217164