分枝杆菌噬菌体D29 holin基因的克隆及其编码蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-11-23 11:09

  本文关键词：分枝杆菌噬菌体D29 holin基因的克隆及其编码蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：目的研究分枝杆菌噬菌体D29holin基因编码蛋白的理化特点及生物学特性,分析噬菌体抗结核菌的潜力。方法根据GenBank中登录的分枝杆菌噬菌体D29holin基因序列设计上、下游引物,以分枝杆菌噬菌体D29基因组为模板,PCR扩增holin基因,构建重组质粒pET32a-holin,进行双酶切鉴定、测序鉴定及生物信息学分析。结果 PCR扩增得到序列正确的holin基因产物并成功构建重组质粒pET32a-holin。进化分析显示分枝杆菌噬菌体D29holin基因与已知有尾分枝杆菌噬菌体Chy1、Chy4、Chy5holin基因亲缘关系较近。生物信息学分析显示,该基因编码Holin蛋白为稳定、疏水性蛋白,具有2个跨膜区域和亲水性C-端;二级结构中以α-螺旋和无规则卷曲为主,有信号肽,蛋白序列中存在2个丝氨酸磷酸化位点。结论分枝杆菌噬菌体D29 Holin蛋白的两个跨膜区及亲水性C-端构象发生变化,有助于阐明Holin"定时"打孔及启动噬菌体裂解细菌的机制,为研发抗结核Holin多肽药物奠定了基础。
【作者单位】： 潍坊医学院医学检验学系;潍坊医学院临床医学院病原生物学教研室;
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81100006) 山东省自然科学基金项目(No.ZR2010HM073)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： *?**?结核病是由结核分枝杆菌引起的慢性传染病,长期不规范抗生素治疗导致的耐多药结核菌株的危害日益凸显[1]。耐药结核分枝杆菌呈增多趋势[2],即使新型抗生素也可出现细菌耐药性。分枝杆菌噬菌体D29[3]是一种可侵染快生型和慢生型分枝杆菌的裂解性dsDNA病毒,具有抗菌作用,但

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