陆地棉PIP亚家族基因的克隆及表达特征分析
发布时间:2017-11-28 17:20
本文关键词:陆地棉PIP亚家族基因的克隆及表达特征分析
【摘要】:该研究以陆地棉苯基香豆满苄基醚还原酶(phenylcoumaran benzylic ether reductase,PCBER)氨基酸序列为探针,利用Blastp从陆地棉基因组数据库中发现了6个同源性较高的基因。根据6个基因序列设计引物,利用RT-PCR技术从陆地棉纤维细胞中克隆出了这6个基因的全长cDNA序列,分别命名为GhPCBER1、GhPCBER2、GhPCBER3、GhIFR、GhPLR1和GhPLR2。多重序列比对和进化树分析发现,6个蛋白均含有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基,属于PIP亚家族。实时荧光定量PCR结果显示,除GhPLR1之外其他5个PIP亚家族基因均在纤维细胞中优势或特异表达;在纤维发育过程中,GhPCBER1、GhPCBER2、GhPCBER3和GhIFR的表达均表现为先上升后下降,GhPCBER1和GhPCBER2在花后21d表达量达到最高,GhPCBER3和GhIFR在花后18d达到最高,GhPLR1和GhPLR2在纤维中的表达量呈持续上升趋势。根据基因的表达特征,推测PIP亚家族可能在棉纤维的发育过程中发挥着重要作用。
【作者单位】: 石河子大学农学院新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室;石河子大学药学院;
【基金】:国家自然科学基金(31460360)
【分类号】:S562;Q943.2
【正文快照】: 棉花是全球性的重要经济作物,是纺织工业最主要的天然纤维来源。成熟棉纤维含有90%以上的纤维素和少量的非纤维素碳水化合物,如木糖葡聚糖、葡聚糖和果胶多糖等[1-2]。纤维素的合成是棉纤维发育过程中主要的代谢途径,近期的研究表明棉纤维中存在苯丙烷代谢途径且在纤维次生壁,
本文编号:1234746
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