杜梨2个MYB转录因子基因的克隆及序列分析

发布时间：2017-12-02 11:16

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【摘要】：【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、TMHMM、Signal P、Plant-m Ploc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等软件对氨基酸序列进行分析。【结果】克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全长,Gen Bank登录号分别为KX272614和KX272615。2者均含有MYB保守结构域,二级结构均以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-折叠为主,亚细胞定位分析表明2者均定位于细胞核中。其中,Pb3RMYB属于3R-MYB亚家族,全长2 355 bp,ORF长1 710bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为62 077.3 Da,等电点为7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB与已报道的其他物种3RMYB具有较高的相似度。Pb4RMYB属于4R-MYB亚家族,全长3 625 bp,ORF长2 913 bp,编码970个氨基酸,蛋白分子质量约为109 600.6 Da,等电点为7.41。【结论】获得了2个杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分别属于3RMYB和4R-MYB亚家族。
【作者单位】： 山东省果树研究所;
【基金】：山东省自然科学基金(ZR2015YL075) 山东省农业科学院青年科研基金(2015YQN41) 山东省良种工程项目(梨优质矮化、多抗功能基因挖掘与种质创新利用2014) 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-31)
【分类号】：S661.2
【正文快照】： MYB转录因子是植物转录因子中数量最多、功能最多样的家族之一,具有高度保守的DNA结合域——MYB结构域,广泛分布于植物、动物和真菌[1]。在每个MYB结构域中,一般都含有3个保守的色氨酸残基,其间隔为18~19个氨基酸,是疏水核心的重要成分,对于维持螺旋-转角-螺旋的构型具有重要

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本文编号：1244721