螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析

发布时间：2017-12-02 12:28

  本文关键词：螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析

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【摘要】：在NCBI基因组数据库中可检索到3个钝顶螺旋藻藻株、1个极大螺旋藻藻株、1个盐泽螺旋藻藻株和1个螺旋藻属未定种的藻株基因组序列。6个螺旋藻基因组序列来源的糖苷酶基因共计32个,编码蛋白含260~1 084个氨基酸,BLAST序列比对显示,与非螺旋藻种属来源的已知序列的相似性在49%~84%之间。系统进化分析表明,32个糖苷酶基因聚类成8个簇,另有3个基因分别单独构成进化分支。酶学功能预测显示,这些糖苷酶基因分别属于8个糖苷酶家族(GH3、GH9、GH13、GH23、GH25、GH38、GH57、GH104),具有8种糖苷酶催化活性(纤维素酶、溶菌酶、α-甘露糖苷酶、α-淀粉酶、普鲁兰酶、1,4-α-葡聚糖分支酶、肽聚糖结合功能、β-葡萄糖苷酶)。
【作者单位】： 中国科学院南海海洋研究所/中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室;
【基金】：海南省科技兴海专项(2015XH04) 广东省海洋渔业科技与产业发展专项(A201501C09)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 螺旋藻(Spirulina)是一种多细胞丝状微藻,是微藻产业的重要藻种,具有极高的开发价值。螺旋藻属于蓝藻门(Cyanophyta)、段殖藻目(Hormogonales)、颤藻科(Oscillatoriaceae)、螺旋藻属(Spirulina)。螺旋藻现已改名为节旋藻(Arthrospira),但由于螺旋藻这一名称一直被广泛使用,因

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本文编号：1244942