槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

发布时间：2017-12-08 00:08

  本文关键词：槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

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【摘要】：为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.
【作者单位】： 福建农林大学动物科学学院;福建省农业科学院畜牧兽医研究所;
【基金】：科技部科技基础性工作专项(2014FY120800) 福建省省属公益类科研院所专项(2014R1023-12)
【分类号】：S828
【正文快照】： 以转录组测序为代表的新一代高通量测序技术能够从整体水平研究生物个体在特定组织和特定时刻的基因表达情况[1-4],目前该技术已广泛应用于生物学、医学、临床和药物等研究领域[5].与传统的基因芯片技术相比,转录组测序无需预先设计特异性探针,能在全基因组范围内以单碱基分辨

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本文编号：1264299