大葱AfCER1基因的克隆及表达分析

发布时间：2017-12-10 02:07

  本文关键词：大葱AfCER1基因的克隆及表达分析

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【摘要】：基于大葱RNA-seq转录组数据库中蜡质相关基因Af CER1的序列设计引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技术获得Af CER1(Allium fistulisum CER1)的全长c DNA序列,并通过生物信息学手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析Af CER1基因在大葱野生型和突变型植株中的空间表达模式。结果表明,Af CER1基因全长为2 144 bp,包含一个1 857 bp完整的开放阅读框(ORF),编码618个氨基酸。蛋白序列比对分析表明,Af CER1与其他物种的CER1具有相似的结构域:脂肪酸羟化酶结构域和WAX2-C结构域。由RT-PCR的结果可知,Af CER1基因在大葱的根、叶鞘、叶片等部位均有表达,且在野生型和突变型植株中的表达量有差异。Real-time PCR分析表明,在大葱的根和叶鞘及刚见光的叶片中,Af CER1在突变型植株中的表达量相对野生型少;而在见光较多的叶片部位,Af CER1在突变型植株中的表达量却比野生型多。研究可为大葱蜡质合成的分子机制提供理论基础。
【作者单位】： 山西大学生命科学学院;北京市农林科学院蔬菜研究中心农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室蔬菜种质改良北京市重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金项目(31372066) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX201101010)
【分类号】：S633.1
【正文快照】： 与种质创制重点实验室,蔬菜种质改良北京市重点实验室,北京100097)表皮蜡质是大多数陆地植物角质层的重要组成部分,覆盖于陆地植物的表皮,可以减缓陆地植物对生物和非生物的胁迫,如防止干旱、病虫害,病原体和紫外辐射对植物的侵害[1-2],是植物的保护屏障。受遗传多样性和后天，

本文编号：1272702