基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因

发布时间：2017-12-16 09:04

  本文关键词：基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因

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【摘要】：对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异,本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡(112d)和快大型科宝肉鸡(42d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查。结果,芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个,以科宝肉鸡作为参照,清远麻鸡中上调基因501个,下调基因817个,主要涉及到肌肉发育、能量代谢、脂质代谢等生物学过程。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除了参与肌纤维发育和分化相关信号通路(如Hedgehog信号通路和Ca2+信号通路)外,Wnt信号通路,mTOR信号通路,MAPK信号通路,ErbB信号通路、JAK-STAT信号通路等一些跟能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。与能量代谢相关的信号通路和与肌肉发育相关的信号通路相互作用形成一个调控网络从而影响肌纤维的发育,筛选出了20个在肌纤维生长发育及分化过程中可能具有重要影响的候选基因,但这些差异表达基因在肌纤维的发育和分化过程中的作用尚待深入研究。
【作者单位】： 江苏省家禽科学研究所;
【基金】：国家自然科学基金(31301967) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-42-G03) 江苏省自然科学基金(BK2012268) 江苏省农业科技自主创新资金项目(cx(15)1009)
【分类号】：S831
【正文快照】： 随着人们生活水平的不断提高和消费观念的转变,肉品质愈来愈受到人们的重视。我国是一个禽类品种资源十分丰富的国家,各地方鸡种多以肉质鲜美而著称,尤其是广东的清远麻鸡,素以皮色金黄、肉质嫩滑、皮脆爽、骨软、风味独特而驰名于粤港澳市场。本课题组前期研究发现,相较于快

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