青杨4CL基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-12-25 19:14

  本文关键词：青杨4CL基因的克隆及生物信息学分析　出处：《西南农业学报》2016年07期 　论文类型：期刊论文

  更多相关文章： 青杨 CL基因 克隆 生物信息学分析

【摘要】：4CL是木质素合成途径中的关键酶,对其进行生物信息学分析,为深入研究4CL的作用奠定基础并为进一步改良青杨提供理论支撑。以青杨嫩茎为试材,采用RT-PCR方法克隆青杨4CL基因,使用NCBI、DNAMAN及Ex PASy等一系列在线软件及工具,对青杨4CL基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。克隆了青杨4CL基因,命名为Pc4CL(Gen Bank注册号:KJ490636)。该基因全长1623 bp,开放阅读框为1~1611 bp,编码536个氨基酸,含有4CL的保守域SSGTTGLPKGV和GEICIRG及催化活性残基His-234。Pc4CL与Pt C4CL同源性最高达97.95%。
【作者单位】： 西南科技大学植物细胞工程实验室;四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心;
【基金】：国家自然科学基金青年基金项目(31400257,31400333) 四川省“十二五”重点公关资助项目(2011YZGG-10) 四川省应用基础研究基金资助项目(2013JY0182) 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助(12zxsk07,13zxsk01)
【分类号】：S792.113
【正文快照】： 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:coen-zyme A ligase,4CL,EC6.2.1.12)是苯丙烷类代谢途径的最后一个酶,能以不同结构的羟基苯乙烯酸为底物,即4CL同工酶可能控制不同分支途径的碳流量,进而形成不同的木质素单体(松柏醇、芥子醇和香豆醇)[1-2]。木质素是植物体正常生长所必须

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 胡甘雨;司风玲;车燕飞;张玉娟;陈斌;;葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J];西南大学学报(自然科学版);2014年01期

2 姚杨;黄原;苏杰;;东亚三角涡虫Rab蛋白cDNA序列的克隆与生物信息学分析[J];生物技术通报;2012年02期

3 张媛;张钟仁;咸丽霞;邢国芳;;玉米谷胱甘肽过氧化物酶生物信息学分析[J];山西农业科学;2013年08期

4 晁哲;林哲敏;刘海隆;张星;郑心力;黄丽丽;谢亮;王峰;;鸡热休克蛋白70基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析[J];中国畜牧兽医;2014年03期

5 蔡小宁;陈茜;杨平;任源浩;;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2008年03期

6 陈尘;王政军;曹鑫林;王U喼，

本文编号：1334082