人CITED4基因及蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-12-27 00:11

本文关键词：人CITED4基因及蛋白的生物信息学分析　出处：《生物技术》2016年06期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：[目的]预测人CITED4基因启动子信息及其蛋白质的理化性质、亲疏水性、细胞亚定位、蛋白质结构、相互作用蛋白质以及GO注释,以期为发现其新功能提供理论和结构基础。[方法]利用Promoter Scan、Prot Param和Clustal X2.1等预测分析CITED4基因及其蛋白的相关信息。[结果]CITED4基因有2个启动子,其转录活性受SP1、AP-2和CREB影响;其蛋白质是由184个氨基酸组成的主要定位于细胞核的不稳定疏水蛋白质,不稳定系数为65.05;氨基酸序列在152~173间保守性强;二级结构含有47个α螺旋16个β折叠;三级结构的建立需要更多可靠的模板,CITED4通过与AP-2等转录因子相互作用调控多个基因的转录活性。[结论]CITED4表达受SP1、AP-2和CREB的调控,CITED4蛋白通过调节多个靶基因的转录调控人体正常生理或病理状态。
[Abstract]:[Objective] to predict human CITED4 gene promoter information and protein physicochemical properties, hydrophobicity, cell Sublocation, protein structure, interacting proteins and GO annotations, in order to provide theoretical and structural basis for finding new functions. [Methods] the Promoter Scan, Prot Param and Clustal X2.1 were used to predict the related information of the CITED4 gene and its protein. The]CITED4 gene 2 promoter and its transcriptional activity by SP1, AP-2 and CREB; the protein is not stable hydrophobic protein composed of 184 amino acids was mainly localized in the nucleus, the instability coefficient is 65.05; the amino acid sequence between 152~173 conservative strong; the two stage structure containing 47 alpha helix 16 beta folding; establishment of three level structure needs more reliable template, transcriptional regulation by CITED4 and AP-2 transcription factor interactions of multiple genes. [conclusion the expression of]CITED4 is regulated by SP1, AP-2 and CREB, and the CITED4 protein regulates the normal physiological or pathological state of the human body by regulating the transcription of multiple target genes.
【作者单位】：天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市肿瘤防治重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金项目(“mTOR调控P62降解在胶质瘤自噬中的作用及其机制研究”,No.81602213)
【分类号】：Q811.4
【正文快照】： CITED4(CREB结合蛋白/具有富含ED尾端的P300蛋白相互作用反式激活物,成员4)是CITED家族的一员,参与包括TGFβ(转化生长因子β)、ER(雌激素受体)、TFAP2(人类同种型相互作用转录因子AP2)和HIF1α(缺氧诱导因子1)等基因的活性调节。CITED1(msg1)、CITED2(mrg1,p35srg)和CITED4(m

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