西门塔尔牛瘤胃木聚糖酶基因的克隆及相关序列分析
本文关键词：西门塔尔牛瘤胃木聚糖酶基因的克隆及相关序列分析 出处：《中国生物制品学杂志》2016年02期 论文类型：期刊论文
【摘要】：目的克隆西门塔尔牛(Simmental)瘤胃木聚糖酶基因Rua11A,并进行相关序列分析。方法采用巢式PCR及单侧PCR技术从西门塔尔牛瘤胃微生物宏基因组DNA内直接克隆木聚糖酶基因Rua11A,并利用生物信息学软件对该基因序列及其编码氨基酸序列进行预测和分析。结果拼接后获得了1 278 bp的Rua11A编码区DNA序列,包括762 bp的木聚糖酶编码区、102 bp的连接序列编码区和411 bp的碳水化合物结合域(carbohydrate binding module,CBM)编码区,共编码425个氨基酸。氨基酸序列N-末端有1处富含疏水性氨基酸,不存在跨膜结构域;包含31个氨基酸的信号肽(signal peptide)及394个氨基酸的成熟肽(mature peptide),且理化性质稳定;预测的Rua11A空间结构具有11家族木聚糖酶的典型特征,属于CBM第四家族;含有11家族木聚糖酶高度保守的氨基酸片段及催化活性中心(catalytic active center)。结论成功克隆了西门塔尔牛瘤胃木聚糖酶基因Rua11A,并进行了相关序列分析,为Rua11A的异源高效表达及分子改造奠定了基础。
[Abstract]:......
【作者单位】： 扬州大学动物科学与技术学院;云南省草地动物科学研究院;
【基金】：国家自然科学基金(31472067) 国家重点863项目(2013-AA102505-5) 云南省重大基础研究计划(2013FC004) 江苏省高校自然科学研究面上项目资助(15KJB230004) 扬州大学科技创新培育基金(2015CXJ055)
【分类号】：Q78
【正文快照】： 木聚糖(xylan)是植物细胞壁中半纤维素(he-micellulose)的重要组分,约占细胞干重的35%,是自然界中继纤维素(cellulose)之后含量最丰富的可再生生物资源[1]。由于木聚糖结构的复杂性,将其彻底水解需要一系列酶的协同作用,其中最关键的酶是β-1,4-内切木聚糖酶(β-1,4-endoxylan
【共引文献】
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本文编号：1352597
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