银杏两个WD40转录因子基因克隆及序列分析
发布时间:2018-01-22 05:05
本文关键词: 银杏 类黄酮 WD转录因子 基因克隆 出处:《北方园艺》2017年18期 论文类型:期刊论文
【摘要】:WD40转录因子也称WDR(WD repeat)蛋白,是一种古老蛋白家族,参与调节类黄酮次生代谢途径中多种酶基因的表达,从而影响类黄酮的积累。以三年生银杏苗为试材,采用RT-PCR和RACE-PCR方法,研究了银杏WD40基因序列,以期深入了解银杏叶类黄酮合成代谢的分子机理。结果表明:GbWD401序列包含一段2 313bp的开放阅读框,编码一个770aa的肽链;GbWD402序列包含一段1 605bp的开放阅读框,编码一个534aa的肽链。银杏GbWD401和GbWD402基因推测编码蛋白序列均含有典型WD40重复基序。GbWD401蛋白序列与无油樟AtWD401相似性为49%,GbWD402蛋白序列与无油樟AtWD402相似性为78%。系统进化树发现,GbWD401与无油樟AtWD401、荷花NnWD40划归为同一分支;而GbWD402与无油樟AtWD402划归为另一分支。
[Abstract]:WD40 transcription factor, also known as WDR(WD repeat) protein, is an ancient protein family involved in regulating the expression of many enzyme genes in the secondary metabolism pathway of flavonoids. In order to influence the accumulation of flavonoids, the WD40 gene sequence of three year old Ginkgo biloba seedlings was studied by RT-PCR and RACE-PCR. In order to understand the molecular mechanism of flavonoid biosynthesis in Ginkgo biloba leaves, the results showed that the 1: GbWD401 sequence contained an open reading frame of 2313 BP, encoding a peptide chain of 770 AA. The GbWD402 sequence contained a 1 605bp open reading frame. It encodes a 534aa peptide chain. The deduced protein sequences of GbWD401 and GbWD402 genes of Ginkgo biloba contain typical WD40 repeat motif. GbWD401 protein sequence and Cinnamomum camphora A protein sequence. TWD401 similarity was 49%. The similarity between GbWD402 protein sequence and AtWD402 was 78. GbWD401 and AtWD401 were found in phylogenetic tree. NnWD40 of lotus flower was classified as the same branch; GbWD402 and Cinnamomum camphora AtWD402 were classified as another branch.
【作者单位】: 武汉轻工大学生物与制药工程学院;
【基金】:国家自然科学基金资助项目(31270717,31400556) 湖北省自然科学重点资助项目(2013BHE029)
【分类号】:Q943.2;S792.95
【正文快照】: 银杏(Ginkgo biloba L.)属裸子植物银杏科银杏属落叶乔木,又名白果、公孙树[1]。银杏叶具有很高药用价值,其主要有效成分为类黄酮和萜内酯。类黄酮是一类以C6-C3-C6为基本结构或具有苯基苯并吡喃结构的植物次生代谢物[2],银杏叶中类黄酮主要包括单黄酮、双黄酮、儿茶素等三大
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