中国朝鲜族和汉族人群的6个Y染色体STR基因座的遗传多态性分析
本文关键词： Y-STR 复合扩增 遗传多态性 法医学 朝鲜族 出处：《延边大学》2017年硕士论文 论文类型：学位论文
【摘要】：目的:为探究Y染色体遗传标记STR基因座在不同民族间的遗传多态性,本研究通过建立6个Y染色体STR基因座复合扩增体系获得中国朝鲜族和汉族群体的遗传多态性等相关法医学参数,通过群体间遗传距离分析探究不同地域、不同民族间遗传差异,为建立朝鲜族STR基因组数据库提供基础数据,为群体遗传学分析提供参考数据。方法:采用PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色技术对200名中国朝鲜族和200名汉族个体的5个单拷贝STR基因座(DYS449、DYS461、DYS508、DYS531、DYS594和1个多拷贝基因座DYF406S1进行检测,运用Excel办公软件、SPSS、Arlequin3.5和Mega4.1软件进行统计学分析。结果:5 个单拷贝 Y-STR 基因座 DYS449、DYS461、DYS508、DYS531、DYS594在朝鲜族群体中分别检出13、6、4、4、5个等位基因,遗传多态性(GD)依次是0.8436、0.6047、0.5662、0.5303、0.3310,在汉族群体中分别检出11、6、5、4、6个等位基因,遗传多态性(GD)依次是0.8690、0.6344、0.4815、0.5511、0.3850;多拷贝基因座DYF404S1在朝鲜族群体中检测出8个等位基因,26种单倍型,单倍型多态性(HD)为0.9260,个人识别能力(DP)为0.9214,在汉族群体中检测出8个等位基因,24种单倍型,单倍型多态性(HD)为0.9107,个人识别能力(DP)为0.9062,累计6个Y-STR基因座在朝鲜族中构成167种单倍型,单倍型多态性(HD)为0.9981,单体型辨别能力(DC)值为0.8350,匹配概率(MP)为6.85×10-3,个人识别能力(DP)值为0.9932,在汉族群体中,构成181种单倍型,单倍型多态性(HD)为0.9989,单体型辨别能力(DC)值为0.9050,匹配概率(MP)为6.05 ×10-3,个人识别能力(DP)值为0.9940。遗传距离结果显示同民族即使不同地域之间遗传差异不明显,不同民族即使同地域遗传差异显著。结论:快速突变基因座在朝鲜族和汉族两群体中的遗传多态性较高,其他基因座DYS461、DYS508、DYS531在这两群体中也展现出良好的遗传多态性;基因座DYS594在两群体中遗传多态性低;通过群体间遗传距离分析,证实了群体遗传学之间的地域性、民族性和种族性差异;6个Y-STR基因座的法医遗传学数据可为建立中国朝鲜族STR基因座数据库提供基础数据,也可为群体遗传学和法医学应用提供参考数据。
[Abstract]:Objective: to investigate the genetic polymorphism of Y chromosome marker STR locus in different ethnic groups. In this study, we established 6 Y chromosome STR loci multiple amplification system to obtain the genetic polymorphism of Chinese Korean and Han populations and other related forensic parameters, and analyzed the genetic distance between populations to explore different regions. The genetic differences among different ethnic groups provided basic data for the establishment of Korean STR genome database and reference data for population genetic analysis. Methods: PCR amplification was used. Polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining technique were used to detect five single copy STR loci DYS449DYS461 and DYS508 in 200 Chinese Korean and 200 Han Chinese individuals. DYS531 DYS594 and one multi-copy locus DYF406S1 were detected, and Excel office software was used to detect DYS594. Results: DYS449 / DYS461 / DYS508 / 5 single copy Y-STR loci were analyzed by Arlequin3.5 and Mega4.1 software. DYS531 and DYS594 alleles were detected in Korean population respectively. The alleles of 13YS 531 and 5 alleles were detected respectively, and the genetic polymorphism of DYS594 was 0.8436N0. 6047, respectively. The genetic polymorphism (GDG) was 0.8690 in the Han population. The alleles of 1166 alleles and 6 alleles were detected in the Han population. 0.6344N 0.4815U 0.5511U 0.3850; There were 26 haplotypes of 8 alleles detected in Korean population with multiple copy loci (DYF404S1), and the haplotype polymorphism (HD) was 0.9260. The individual recognition ability was 0.9214. 24 haplotypes of 8 alleles and 0.9107 haplotypes were detected in Han population. The total number of Y-STR loci was 0.9062.167 haplotypes and 0.9981 haplotypes were constructed in 6 Y-STR loci in Korean nationality. The values of DCV, MPP and DPP of haplotype discrimination were 0.8350, 6.85 脳 10 ~ (-3) and 0.9932, respectively. Among 181 haplotypes, the HD of haplotypes was 0.9989, the DCvalue of haplotype discrimination was 0.9050, and the matching probability was 6.05 脳 10 ~ (-3). The value of personal identification ability was 0.9940. The genetic distance showed that there was no significant genetic difference between different regions even in the same ethnic group. Conclusion: the rapid mutation loci are highly polymorphic in Korean and Han populations, and other loci are DYS461 and DYS508. DYS531 also showed good genetic polymorphism in these two populations. The genetic polymorphism of locus DYS594 was low in the two populations. Through the analysis of genetic distance between populations, the regional, ethnic and ethnic differences among population genetics were confirmed. The forensic genetic data of 6 Y-STR loci can provide basic data for the establishment of STR locus database of Chinese Korean nationality, and also provide reference data for population genetics and forensic application.
【学位授予单位】：延边大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：D919
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，本文编号：1491361
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