三种非结核分枝杆菌esxB基因的克隆与序列分析

发布时间：2018-02-20 17:38

  本文关键词： 新金分枝杆菌 母牛分枝杆菌 耻垢分枝杆菌 esxB 表位　出处：《黑龙江畜牧兽医》2017年05期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为了探讨非结核分枝杆菌中EsxB蛋白的生物学功能,试验以实验室分离的母牛分枝杆菌、新金分枝杆菌和耻垢分枝杆菌为对象,克隆了esxB基因,应用生物信息学方法进行系统发生分析,对EsxB蛋白进行生物学特性、保守区分析以及抗原表位、可能的三级结构预测。结果表明:克隆的3种非结核分枝杆菌的esxB基因大小分别为309 bp、303 bp、294 bp,推导的氨基酸序列与Gen Bank中登录的相应菌种的氨基酸序列同源性分别为95%或97%、100%、100%;属于WXG100蛋白超家族中CFP-10亚家族成员,具有该亚家族保守的α-螺旋和Yxxx D/E序列;预测到3条肽链线性B细胞表位各1个,T细胞表位各4个、9个、5个,部分T细胞表位与结核杆菌CFP10的CD8+T细胞表位有5~6个共同氨基酸。
[Abstract]:In order to investigate the biological function of EsxB protein in non - mycobacterium tuberculosis , the esxB gene was cloned , and the esxB gene was cloned . The sequence identity of esxB gene was 309 bp , 303 bp and 294 bp . The deduced amino acid sequence identity was 95 % or 97 % , 100 % and 100 % , respectively .

【作者单位】： 吉林农业大学动物科技学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31272566) 吉林省科技发展计划项目(20140204069NY)
【分类号】：S852.61

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本文编号：1519589