黄瓜CsWRKY23基因的生物信息学及表达分析

发布时间：2018-02-21 08:32

  本文关键词： 黄瓜 WRKY 生物信息学 荧光定量PCR　出处：《作物杂志》2017年05期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：WRKY转录因子是植物中广泛存在的一种转录因子,参与植物的生物胁迫与非生物胁迫。采用RTPCR克隆黄瓜CsWRKY23基因cDNA序列,对序列进行结构域、基因结构分析,构建系统发育树,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析该基因在黄瓜根、叶组织中的表达。结果表明:CsWRKY23的cDNA开放读码框全长1 431bp,含有5个外显子,4个内含子;编码476个氨基酸,含有两个WRKY结构域,编码蛋白的分子量为52.2kDa、等电点为6.43;系统发育分析表明CsWRKY23与拟南芥AtWRKY33同源。qRTPCR结果表明该基因响应低温胁迫,并在根、叶组织中的表达均上调。本研究为进一步鉴定该基因在非生物胁迫的功能奠定了基础。
[Abstract]:WRKY transcription factor is a widespread transcription factor in plants, which is involved in plant biotic stress and abiotic stress. RTPCR was used to clone the cDNA sequence of cucumber CsWRKY23 gene, and to construct phylogenetic tree. The expression of the gene in cucumber roots and leaves was analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR qRT-PCR.The results showed that the cDNA open reading frame of 1 / CsWRKY23 contained 1 431 BP, 5 exons and 4 introns, encoding 476 amino acids and containing two WRKY domains. The molecular weight of the encoded protein was 52.2 kDa and the isoelectric point was 6.43.The phylogenetic analysis showed that CsWRKY23 and Arabidopsis AtWRKY33 homology. This study laid a foundation for further identification of the function of the gene in abiotic stress.
【作者单位】： 沈阳师范大学生命科学学院;沈阳食品检验所;
【基金】：国家自然科学基金青年基金项目(31301815) 沈阳师范大学重大孵化项目(ZD201621)
【分类号】：Q943.2;S642.2

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