湖南部分地区猪链球菌SAO蛋白基因的分子流行病学调查

发布时间：2018-02-21 23:06

  本文关键词： 猪链球菌 流行病学调查 PCR SAO蛋白　出处：《湖南农业大学》2016年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：本研究参考GenBank上公布的猪链球菌序列,针对SAO蛋白基因序列设计了检测引物,并命名为SAO-D,所扩增的目的条带大小为400bp。为了同时能成功区分SAO蛋白基因不同变异体和鉴定SAO蛋白基因缺失,针对SAO蛋白全长设计了特异性引物,并命名为SAO-FL,所扩增的目的条带大小根据的SAO蛋白基因的变异情况不一而有区别。其中分别能扩增大、中、小三种大小片段的目的条带,SAO-L条带大小为2500bp左右,SAO-M条带大小为2000bp左右,SAO-S条带大小为1700bp左右。SAO蛋白基因缺失菌株能成功扩增300bp的目的条带。本实验室一共分离并保存了318株猪链球菌,有269株能成功鉴定血清型,共涵盖的血清型25个。对269株猪链球菌进行检测,发现血清型16型所有菌株无法检测到SAO蛋白基因,同时在血清型2型、8型、9型、15型、28型、31型也有部分菌株无法检测到SAO蛋白基因。能成功检测到SAO蛋白基因的菌株243株,占总检测量的90.3%,SAO蛋白基因缺失的菌株26株,占总检测量9.7%。在所有能成功检测到SAO蛋白基因的猪链球菌中,SAO-M为SAO蛋白基因主要存在方式,共192株,占总检测量的79%,SAO-L共18株,检测率为7.4%，SAO-S检出率最少,仅7株,检测率为2.9%，还有部分样品依靠SAO-FL无法成功分型,共26株,占总检测量的10.7%。由此可见,SAO蛋白在猪链球菌中普遍存在,并且在SAO蛋白的诸多变异体中,SAO-M是最常见的变异体。
[Abstract]:SAO - M was identified as SAO - D , and the SAO - M band was about 2000 bp . The SAO - M band was about 2000 bp .

【学位授予单位】：湖南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S852.611

【参考文献】

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本文编号：1523080