陆川猪激素敏感性脂肪酶基因的克隆及序列分析

发布时间：2018-03-01 19:43

  本文关键词： 陆川猪 激素敏感性脂肪酶(HSL)基因 克隆 序列分析 蛋白质二级结构　出处：《黑龙江畜牧兽医》2017年01期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为了获得广西陆川猪激素敏感性脂肪酶(HSL)基因编码区序列(CDS),试验从11月龄陆川猪背最长肌组织中提取总RNA,利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法分段扩增出HSL基因CDS。结果表明:成功分段克隆出陆川猪HSL基因CDS,拼接后长度为2 295 bp,与Gen Bank数据库中公布的国内地方猪种梅山猪的同源性为99.9%,与外来猪种长白猪的同源性为99.7%,并发现其1 044位点存在C→T,其碱基T是陆川猪所特有,尚未导致氨基酸突变。利用生物软件构建系统进化树显示,与广西陆川猪遗传距离最近的是梅山猪,它们聚为同一支,最远的是人。陆川猪HSL基因的二级结构包含α-螺旋、β-折叠。
[Abstract]:In order to obtain the coding region of hormone sensitive lipase (HSL) gene of Guangxi Luchuan pig, the HSL gene was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) from the longissimus dorsi muscle tissue of Luchuan pig at the age of 11 months. The results showed that the HSL gene of Luchuan pig was cloned successfully, the length of the splicing was 2 295 BP, the homology with Meishan pig published in the Gen Bank database was 99.9, and the homology with Landrace white pig was 99.7. There are 1 044 loci in it. 鈫扵, its base T is unique to Luchuan pigs and has not resulted in amino acid mutation. The phylogenetic tree constructed by using biological software shows that Meishan pig is the closest genetic distance to Guangxi Luchuan pig, and they are clustered into the same family. The secondary structure of the HSL gene of Luchuan pig contains 伪-helix and 尾-fold.
【作者单位】： 广西大学动物科学技术学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31460606) 广西自然科学基金项目(2013GXNSFBA019077;2014GXNSFAA118131) 广西高校科研一般项目(2013YB004)
【分类号】：S828

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本文编号：1553336