水稻粒形基因GS3的功能标记开发与鉴定

发布时间：2018-03-08 10:19

本文选题：水稻　切入点：粒形　出处：《江苏农业科学》2016年12期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：籽粒的大小和形状是影响水稻产量和稻米品质的主要性状。在基因GS3序列分析的基础上,对该基因第2外显子A/C和第5外显子13 bp Indel的2个变异位点分别开发功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007—2013年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明,第2外显子的A/C变异在籼粳亚种中有着相似的分布频率,并且都对粒长、粒厚和长宽比有极显著的影响。相对于基因型C而言,基因型A在籼粳亚种中都有更长的粒长、更薄的粒厚和更大的长宽比。但是第5外显子的13 bp缺失变异只在粳稻中极低频率(0.74%)出现,属于稀有变异类型,比13 bp插入变异有着更短的粒长和更小的长宽比。这些研究结果为水稻产量和品质育种中充分利用基因GS3的优异等位基因奠定了基础。
[Abstract]:The grain size and shape are the main characters affecting rice yield and rice quality. Based on the GS3 sequence analysis of the gene, functional markers were developed for the two mutation sites of exon 2, A / C, and exon 5, 13 BP Indel, respectively. The results showed that the A / C variation of exon 2 had a similar distribution frequency in indica and japonica subspecies, and all had opposite grain length. Compared with genotype C, genotype A had a longer grain length in indica and japonica subspecies. However, the 13bp deletion of exon 5 was only found in japonica rice at very low frequency (0.74), and it was a rare variant. The results laid the foundation for making full use of the excellent alleles of gene GS3 in rice yield and quality breeding.
【作者单位】：扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(编号:31571624;31071382) 国家重点基础研究发展计划(编号:2010CB125904;2013CBA01405) 江苏省高校自然科学研究重大项目(编号:15KJA210004) 扬州大学大学生学术科技创新基金(编号:x2015616) 江苏高校优势学科建设工程项目
【分类号】：S511

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