基因芯片筛选原发性肝癌患者的差异表达基因

发布时间：2018-03-10 01:31

  本文选题：肝癌　切入点：基因表达谱　出处：《河南医学研究》2016年03期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的利用基因表达谱芯片技术探讨原发性肝癌(PHC)不同阶段(癌组织、癌旁组织、正常组织)差异基因的表达,进一步寻找PHC不同阶段组织中的差异表达基因。方法提取20例肝癌癌组织、癌旁组织和正常组织的总RNA,应用Agilent人类全基因组4×44K基因芯片筛选差异表达基因,采用微阵列类分析(SAS)软件对芯片图像进行分析。结果筛选出癌组织与正常组织差异基因4 175个,其中上调基因1 850个,下调基因2 325个。对筛选出的差异基因进行GO分类,主要分为催化活性、信号转导、酶活性调节、转录活性调节、蛋白运输功能、细胞生长、凋亡等功能过程。结论利用基因芯片技术可高通量地筛选出PHC不同阶段组织的差异表达基因,为进一步阐明PHC的发生机制提供实验依据。
[Abstract]:Objective to investigate the differentially expressed genes at different stages (cancer tissues, adjacent tissues, normal tissues) of primary hepatocellular carcinoma (PHC) by using gene expression microarray technique. Methods Total RNAs of 20 cases of HCC tissues, adjacent tissues and normal tissues were extracted, and the differentially expressed genes were screened by 4 脳 44K gene chip in the whole human genome of Agilent. Microarray analysis software was used to analyze the microarray image. Results 4,175 differentially expressed genes were screened out, including 1 850 up-regulated genes and 2 325 down-regulated genes. The differential genes were classified by go. Mainly divided into catalytic activity, signal transduction, enzyme activity regulation, transcriptional activity regulation, protein transport function, cell growth, Conclusion the differentially expressed genes in different stages of PHC can be screened with high throughput by using gene chip technique, which provides experimental basis for further elucidation of the mechanism of PHC.
【作者单位】： 新乡医学院;南阳市中心医院普外科;
【分类号】：R735.7

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本文编号：1591189