棉花类结瘤素MtN21基因家族生物信息学分析

发布时间：2018-03-12 20:30

  本文选题：生长素　切入点：保守结构域　出处：《植物学报》2016年04期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：结瘤素基因主要参与豆科植物根瘤的形成。非结瘤植物中也存在类结瘤素基因,主要调控植物的生长发育。Mt N21(Medicago truncatula NODULIN 21)基因家族属于类结瘤素基因家族,仅少数成员已被鉴定。以拟南芥(Arabidopsis thaliana)Mt N21家族为参考,对棉花(Gossypium hirsutum)Mt N21基因家族进行了生物信息学分析,发现棉花与拟南芥的Mt N21基因同源性较高,有共同的跨膜结构域Eam A和PLN00411;棉花中仅含PLN00411结构域的Mt N21蛋白等电点低于含Eam A结构域的蛋白;亚细胞定位主要在质膜、液泡膜和叶绿体,少数在细胞核;Mt N21蛋白具有膜内侧的磷酸化位点。研究结果表明,棉花Mt N21为跨膜蛋白,具有转运活性,可能在棉花生长发育和病原体免疫方面发挥一定的作用。
[Abstract]:Nodulin genes are mainly involved in the formation of rhizobia in legumes. There are also nodule like genes in non-nodular plants, which mainly regulate the growth and development of plants. Mt N21Medicago truncatula NODULIN 21) gene family belongs to the nodulin-like gene family. Only a few members have been identified. Using Arabidopsis thaliana)Mt N21 family as a reference, the bioinformatics analysis of cotton Gossypium hirsutum)Mt N21 gene family was carried out. It was found that cotton and Arabidopsis mtN21 gene had high homology. There were common transmembrane domains Eam A and PLN00411.The isoelectric point of Mt N21 protein containing only PLN00411 domain was lower than that of Eam A domain, and the subcellular localization was mainly in plasma membrane, vacuolar membrane and chloroplast. The results showed that cotton Mt N21 was a transmembrane protein with transmembrane activity, which might play a role in cotton growth and development and pathogen immunity.
【作者单位】： 河南师范大学生命科学学院;
【基金】：河南省高校科技创新团队支持计划 河南省生物学重点学科 河南师范大学博士启动课题(No.qd14172)
【分类号】：Q943.2

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本文编号：1603175