柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位
本文选题:柑橘 切入点:柑橘黄化脉明病毒 出处:《园艺学报》2017年08期 论文类型:期刊论文
【摘要】:柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)是一种正义单链RNA病毒。其基因组含有6个开放阅读框(ORF),其中ORF2、ORF3和ORF4组成了三基因连锁结构(triple gene block,TGB)。以感染CYVCV的尤力克柠檬[Citrus limon(L.)Burm.f.]植株的总RNA为模板,扩增和克隆了CYVCV的TGB基因,并开展了其编码蛋白的理化性质和分子特性等生物信息学分析;进而通过In-Fusion~?技术构建了TGB各基因的亚细胞定位载体,经农杆菌介导转化洋葱表皮细胞并在荧光显微镜下进行亚细胞定位观察。生物信息学分析结果表明,CYVCV-TGB具有与Potexvirus属病毒TGB相似的理化性质和分子特性,可能参与病毒在寄主中的运动且需要外壳蛋白的参与。亚细胞定位结果显示,TGBp1定位于细胞壁(膜)上,TGBp2和TGBp3主要定位于细胞壁(膜),少量呈星点状定位于细胞内。研究结果为揭示CYVCV在寄主中的运动机理奠定了基础。
[Abstract]:Citrus yellow vein clearing virus (CyvCVV) is a sense single-stranded RNA virus. Its genome contains six open reading frames, ORF3 and ORF4, which form a triplex gene block TGBV. The total RNA of CYVCV infected Citrus limonL.Burm.f. was used as a template. The TGB gene of CYVCV was amplified and cloned, and the physicochemical and molecular properties of its encoded protein were analyzed by bioinformatics. The subcellular localization vectors of TGB genes were constructed by using this method. Agrobacterium tumefaciens mediated transformation of onion epidermis cells and observation of subcellular localization under fluorescence microscope. Bioinformatics analysis showed that CYVCV-TGB had similar physicochemical and molecular properties as Potexvirus virus TGB. The subcellular localization results showed that TGBp1 was localized on the cell wall (membrane), TGBp2 and TGBp3 were mainly located in the cell wall (membrane), and a few of them were stellate in the cell. The results laid a foundation for revealing the mechanism of CYVCV in host.
【作者单位】: 西南大学/中国农业科学院柑桔研究所国家柑橘工程技术研究中心;
【基金】:国家公益性行业(农业)科研专项(201203076) 重庆市两江学者计划项目 重庆市基础及前沿研究项目(CSTC2014jcyj A80033) 中央高校基本科研业务专项(XDJK2017B024)
【分类号】:S436.66
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,本文编号:1603091
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