植物颗粒结合淀粉合酶GBSS基因家族的进化

发布时间：2018-03-25 14:19

  本文选题：基因组　切入点：系统发育　出处：《植物学报》2017年02期

【摘要】：为全面理解植物颗粒结合淀粉合酶(GBSS)基因在植物中的进化模式并重建其进化历史,利用20种陆生植物和2种藻类植物的基因组数据,通过生物信息学手段,深入挖掘和分析植物类群基因组中GBSS基因家族的构成和基因特点,推测其可能的扩增和丢失规律。结果共识别42条同源序列。系统发育和进化分析表明,GBSS基因起源古老,可能在所有绿色植物的祖先中就已经出现,之后在进化过程中不断发生谱系的特异扩张和拷贝丢失,并最终通过功能分化的形式在植物类群中被固定。
[Abstract]:In order to fully understand the evolutionary model of granular-bound starch synthase (GBSS) gene in plants and to reconstruct its evolutionary history, the genome data of 20 terrestrial plants and 2 species of algae were used by bioinformatics. The composition and characteristics of GBSS gene family in plant genomes were deeply explored and analyzed, and the possible amplification and loss rules were speculated. Results 42 homologous sequences were identified. Phylogenetic and evolutionary analysis showed that the origin of GBSS gene was ancient. It may have been found in the ancestors of all green plants, followed by a series of lineage specific expansion and copy loss during evolution, and eventually fixed in the plant community through functional differentiation.
【作者单位】： 曲阜师范大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金(No.31570218)
【分类号】：Q946

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本文编号：1663516