牛TNS1基因的克隆和生物信息学分析

发布时间：2018-04-15 00:00

  本文选题：牛 + 转基因　； 参考：《黑龙江畜牧兽医》2017年15期

【摘要】：为了克隆牛TNS1基因序列,试验以人TNS1基因序列为探针,通过NCBI在线网站BLAST获得同源性较高的牛表达序列标签(ESTs)及部分mRNA序列,采用RT-PCR方法从牛肌肉组织克隆cDNA序列并与牛ESTs和mRNA序列进行拼接,获得牛TNS1基因序列。结果表明:克隆获得的牛TNS1基因含有32个外显子和31个内含子,编码区长度为5 148 bp,编码1 715个氨基酸。该蛋白含有149个磷酸化位点,分别位于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,二级结构以无规则卷曲为主,含有PTEN_C2、Src同源结构域2(SH2)和磷酸化酪氨酸结合区域(PTB)3个功能结构域。牛TNS1蛋白线粒体靶向肽及分泌通路信号肽所占的比例很小,大部分分布于微体和细胞核内,不属于分泌蛋白。
[Abstract]:In order to sequence the TNS1 gene of cloned cattle, using the human TNS1 gene sequence as probe, we obtained the high homologous bovine expression sequence tags (ests) and some mRNA sequences by NCBI online website BLAST.CDNA sequence was cloned from bovine muscle tissue by RT-PCR method and spliced with bovine ESTs and mRNA sequence to obtain bovine TNS1 gene sequence.The results showed that the cloned bovine TNS1 gene contained 32 exons and 31 introns, and the coding region was 5 148 BP, encoding 1 715 amino acids.The protein contains 149 phosphorylation sites located on serine serine, tyrosine tyrosine Tyr) and threonine Thr) residues. The secondary structure is mainly irregular crimp, and contains three functional domains: PTENC2Src homologue 2SH2) and phosphorylated tyrosine binding region (PTB2).The proportion of bovine TNS1 protein mitochondrial targeting peptide and secretory pathway signal peptide is very small, most of them are distributed in microbody and nucleus, and do not belong to secretory protein.
【作者单位】： 天津农学院动物科学与动物医学学院;
【基金】：国家转基因重大专项项目(2014ZX08007-002)
【分类号】：S823

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本文编号：1751587