丹参中转录因子基因SmMYB-like 1的克隆和表达分析

发布时间：2018-04-15 00:05

  本文选题：丹参 + RR　； 参考：《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2017年03期

【摘要】：利用同源克隆和RACE相结合的方法从丹参中克隆得到1条R2R3 MYB转录因子基因SmMYB-like 1(GenBank登录号为JX997333)的全长cDNA序列。该基因含1个960bp的开放阅读框,编码319个氨基酸,预测其分子量为35.84ku,等电点为6.24。对SmMYB-like 1的氨基酸序列进行多序列比对和系统进化树分析,并对其二级结构和三级结构进行预测。qRT-PCR结果表明:SmMYB-like 1在根、茎、叶和花中均有表达,其中在根中的表达量最低,在叶和花中的表达量较高。构建融合表达载体,利用基因枪轰击洋葱表皮细胞研究SmMYB-like 1蛋白的亚细胞定位,发现该蛋白在细胞核和细胞膜中均有分布。
[Abstract]:The full-length cDNA sequence of R2R3 MYB transcription factor gene SmMYB-like 1(GenBank was cloned from Salvia miltiorrhiza by homologous cloning and RACE.The gene contains an open reading frame of 960bp and encodes 319 amino acids with a predicted molecular weight of 35.84kuand a isoelectric point of 6.24.The amino acid sequences of SmMYB-like 1 were analyzed by multiple sequence alignment and phylogenetic tree analysis. The results of qRT-PCR showed that: SmMYB-like 1 was expressed in roots, stems, leaves and flowers, and the lowest in roots.The expression was higher in leaves and flowers.The fusion expression vector was constructed and the subcellular localization of SmMYB-like 1 protein was studied by bombarding onion epidermis cells with gene gun. It was found that the protein was distributed in nucleus and cell membrane.
【作者单位】： 扬州大学生物科学与技术学院;浙江理工大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31700257、81773835) 江苏省高校自然科学基金面上项目(16KJB180032) 中国博士后科学基金面上项目(2015M571826)
【分类号】：Q943.2;S567.53

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本文编号：1751609