麻风树脂肪酸去饱和酶7基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-04-25 18:07

  本文选题：麻风树 + 脂肪酸去饱和酶(FAD)　； 参考：《江苏农业科学》2017年02期

【摘要】：质体型ω-3(Δ15)脂肪酸去饱和酶(FAD7)是多不饱和脂肪酸合成途径中催化亚油酸(Δ9,12-C18∶2)形成α-亚麻酸(Δ9,12,15-C18∶3,ALA)的关键酶。基于麻风树低温锻炼转录组数据,通过逆转录PCR(RT-PCR)技术克隆到麻风树FAD7基因的全长cDNA,命名为JcFAD7。结果表明,该cDNA序列全长1 796 bp,完整开放阅读框1 341 bp,编码446个氨基酸,理论分子量为51.1 ku,等电点为8.92。序列分析表明,JcFAD7编码蛋白包含膜结合FAD蛋白的4个跨膜区、2个膜嵌合区、1个亚铁血红素结合基序及3个组氨酸簇等特征区域。构建系统进化树显示,麻风树JcFAD7蛋白与芍药(Paeonia lactiflora)的亲缘关系最近。
[Abstract]:The plastid type 蠅 -3 (螖 15) fatty acid desaturase (FAD7) is the key enzyme in the synthesis of polyunsaturated fatty acids, which catalyzes the formation of 伪 -linolenic acid (螖 9 ~ (12) -C ~ (18): 2) into 伪 -linolenic acid (螖 _ (12) -C _ (18): 2) in the polyunsaturated fatty acid synthesis pathway. The full-length cDNA of FAD7 gene of Leprosy was cloned by reverse transcription PCR- RT-PCR technique and named JcFAD7 based on the data of hypothermia training transcription group of Leprosy. The results showed that the cDNA sequence was 1 796 BP in length, complete open reading frame 1 341 BP, encoding 446 amino acids. The theoretical molecular weight was 51. 1 ku. the isoelectric point was 8. 92. Sequence analysis showed that the JcFAD7 protein contained four transmembrane regions, two membrane chimeric regions, one heme binding motif and three histidine clusters. The phylogenetic tree showed that JcFAD7 protein was closely related to Paeonia lactiflora.
【作者单位】： 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心;曲靖师范学院生物资源与食品工程学院;云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(编号:31460179)
【分类号】：S794.9

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