桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析

发布时间：2018-05-02 08:32

  本文选题：钙调磷酸酶B类似蛋白 + 桃　； 参考：《西南农业学报》2017年03期

【摘要】：为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用。利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域。进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族。TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区。PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3和5均含有1个N-豆蔻酰化位点。NetPhos 2.0 Server结果显示PpCBLs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CBL的功能提供重要的理论基础。
[Abstract]:The gene structure , chromosome location and coding protein of the gene family of Prunus persica were identified by bioinformatics . The results showed that there were 4 conserved EF domains in the peach genome . The results showed that there were 4 conserved EF domains in the peach genome . The results showed that PpCBL21 , 3 and 5 contained 1 N - myristoylation site .

【作者单位】： 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;中国科学院大学;
【基金】：北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202) 北京市科技计划(Z151100001015005)
【分类号】：S662.1

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本文编号：1833167