应用全基因组芯片技术筛选人卵巢癌SKOV3卡铂耐药细胞系差异表达基因
本文选题:卵巢癌 + 铂类耐药 ; 参考:《现代肿瘤医学》2016年12期
【摘要】:目的:应用基因芯片技术筛选人卵巢癌细胞株中卡铂耐药相关基因。方法:采用人类全基因组表达谱芯片对卵巢癌耐卡铂细胞SKOV3/CB和亲本细胞SKOV3进行差异基因的筛选和分析;用半定量逆转录聚合酶联反应(RT-PCR)对部分芯片结果进行核对验证。结果:共分离筛选出差异基因233个,SKOV3/CB比SKOV3上调的差异基因共有163个,SKOV3比SKOV3/CB上调的差异基因共有70个。这些差异基因按其功能主要可以分为以下几类:物质转运、药物代谢、DNA修复、凋亡、离子通道、转移迁徙、细胞增殖和周期调控及一些未知功能基因。差异基因ANXA6、UGDH和TWIST2的表达情况与基因芯片检测结果一致。结论:卵巢癌的多药耐药是一个多种基因参与的复杂过程。基因芯片技术是一高效筛选多药耐药相关基因的方法,ANXA6、UGDH和TWIST2等基因可能与卵巢癌的多药耐药机制相关。
[Abstract]:Objective: to screen carboplatin resistance related genes in human ovarian cancer cell lines by gene chip technique. Methods: the differentially expressed genes of carboplatin resistant ovarian cancer cell SKOV3/CB and parental cell SKOV3 were screened and analyzed by human genome expression microarray, and partial microarray results were verified by semi-quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: a total of 163 differentially expressed genes (SKOV3 / CB) were up-regulated than SKOV3 (70 genes) compared with SKOV3/CB. According to their functions, these differentially expressed genes can be divided into the following categories: substance transport, drug metabolism DNA repair, apoptosis, ion channel, migration, cell proliferation and cycle regulation, and some unknown genes. The expression of differential gene ANXA 6, UGDH and TWIST2 was consistent with the results of gene chip analysis. Conclusion: multidrug resistance in ovarian cancer is a complex process involving multiple genes. Gene chip technology is a highly effective method for screening multidrug resistance-associated genes. Genes such as ANXA6, UGDH and TWIST2 may be related to the mechanism of multidrug resistance in ovarian cancer.
【作者单位】: 湖北省妇幼保健院妇科;广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科;
【分类号】:R737.31
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本文编号:1860941
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