大豆GmMP基因的功能预测及表达分析

发布时间：2018-05-08 22:12

  本文选题：大豆 + GmMP基因　； 参考：《大豆科学》2017年01期

【摘要】：通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,获得了GmMP基因序列。对GmMP基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmMP基因CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸。GmMP编码的蛋白为疏水性蛋白。结构域分析表明:GmMP含有B3和AUXIN RESPONSE FACTOR结构域,同时该基因是ARF家族的成员。GmMP预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析表明MP在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmMP在叶片中表达量最低,在茎尖中表达量最高,推测其可能参与生长素的代谢途径。
[Abstract]:GmMP gene encoding amino acid sequence and promoter sequence were analyzed by bioinformatics analysis . The results showed that GmMP gene had a full length of 2 802 bp and coded 933 amino acids . GmMP coded protein was hydrophobic protein . The results showed that GmMP contained B3 and Arabidopsis IN RESPONSE FACTOR domains , and the gene was a member of ARF family .

【作者单位】： 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室;
【基金】：抗逆转基因大豆新品种培育专项(2016ZX08004-002)
【分类号】：S565.1

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