小麦TaVIP1家族基因克

发布时间：2018-05-13 23:07

  本文选题：小麦 + TaVIP　； 参考：《作物学报》2017年02期

【摘要】：植物VIP1蛋白(Vir E2 interacting protein 1)与农杆菌侵染植物后T-DNA在细胞内的转运有关,影响植物转化效率,但还未见有关小麦中VIP1基因研究的报道。本研究利用in silico技术从普通小麦中克隆了TaVIP1家族基因,该家族基因全部由4个外显子构成,编码产物相似性高,与拟南芥AtVIP1蛋白质序列相似性仅为50.7%~51.4%。Southern杂交结果表明,TaVIP1基因在小麦基因组中存在3个拷贝。根据小麦3个TaVIP1基因的差异序列设计特异引物,以四倍体小麦Langdon与中国春D组染色体代换系为材料进行PCR检测,结合生物信息学分析,将小麦3个TaVIP1基因分别定位在4AL、4BS和4DS染色体上。亚细胞定位分析表明,TaVIP1蛋白分布于细胞膜、细胞质和细胞核中。农杆菌转化烟草,过表达TaVIP1基因降低了烟草转化效率。小麦TaVIP1基因编码的氨基酸序列与拟南芥AtVIP1基因及烟草NtVIP1基因编码的氨基酸序列相似性很低,这可能是小麦农杆菌转化效率低的原因之一。
[Abstract]:Plant VIP1 protein Vir E2 interacting protein 1 is related to the translocation of T-DNA in the cells after Agrobacterium tumefaciens infection, which affects the efficiency of plant transformation. However, there is no report on the study of VIP1 gene in wheat. In this study, in silico technique was used to clone TaVIP1 family genes from common wheat. The family genes were all composed of four exons, and the encoding products were similar. The sequence similarity of AtVIP1 protein with Arabidopsis thaliana was only the result of 50.7%~51.4%.Southern hybridization, which indicated that there were three copies of TaVIP1 gene in wheat genome. According to the differential sequences of three TaVIP1 genes in wheat, specific primers were designed. The tetraploid wheat Langdon and Chinese spring D chromosome substitution lines were used as materials for PCR detection and bioinformatics analysis. Three TaVIP1 genes of wheat were located on 4AL4 BS and 4DS chromosomes, respectively. Subcellular localization analysis showed that TaVIP1 protein was distributed in cell membrane, cytoplasm and nucleus. Agrobacterium tumefaciens transformed tobacco, overexpression of TaVIP1 gene reduced the efficiency of tobacco transformation. The amino acid sequence of wheat TaVIP1 gene is similar to that of Arabidopsis thaliana AtVIP1 gene and tobacco NtVIP1 gene, which may be one of the reasons for the low transformation efficiency of Agrobacterium tumefaciens.
【作者单位】： 中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程;北方民族大学生物科学与工程学院;安徽省农业科学院作物研究所;
【基金】：国家自然科学基金项目(31401380,31401376)资助~~
【分类号】：S512.1

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：1885217