鸭源鸡杆菌外膜蛋白W基因克隆及结构与功能分析

发布时间：2018-05-14 17:50

  本文选题：鸭源鸡杆菌 + OmpW基因　； 参考：《中国兽医学报》2017年01期

【摘要】：参考GenBank中鸭源鸡杆菌(Gallibacterium anatis,G.anatis)UMN179的外膜蛋白W(outer membrane protein W,OmpW)基因序列设计1对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因进行克隆、测序,并通过生物信息学软件对该蛋白结构与功能进行分析及预测。结果显示:OmpW基因大小为705bp,编码234个氨基酸;与鸭源鸡杆菌UMN179株、F149株及12656/12株的OmpW氨基酸同源性分别为88.9%、78.7%和79.6%;OmpW相对分子质量为25 300,等电点为7.88,是能够稳定存在的蛋白,N端有1个疏水性的α螺旋信号肽,C端有1个疏水性的β折叠区域,并且在外膜表面存在1个保守性的B细胞线性表位。本试验成功克隆了鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因,并对其结构与功能进行初步分析和预测,为进一步研究其生物学功能及其应用奠定基础。
[Abstract]:A pair of primers were designed to clone and sequence the OmpW gene of PDS-RZ-1-SLG strain of GenBank, referring to the gene sequence of the outer membrane protein W(outer membrane protein Wn179 of Gallibacterium anatissimus Gallibacterium anatissima UMN179 in GenBank. The structure and function of the protein were analyzed and predicted by bioinformatics software. The results showed that the size of the 1: OmpW gene was 705bp, encoding 234 amino acids. The homology of OmpW amino acids with UMN179 strain F149 and 12656 / 12 strains were 88.9% and 79.6%, respectively. The relative molecular weight and isoelectric point of OmpW were 25 300 and 7.88 respectively. A hydrophobic beta folding region, And there is a conservative B cell linear epitope on the outer membrane. In this experiment, the OmpW gene of PDS-RZ-1-SLG strain was cloned, and its structure and function were preliminarily analyzed and predicted, which laid a foundation for further study of its biological function and its application.
【作者单位】： 河南农业大学禽病研究所;
【基金】：国家自然科学基金项目资助(31302090) 河南省高校科技创新团队与支持计划资助项目(14IRTSHN015)
【分类号】：S852.61

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