丹参SmbHLH37基因的克
本文选题:丹参 + 碱性螺旋-环-螺旋(bHLH) ; 参考:《农业生物技术学报》2017年06期
【摘要】:碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族在植物的生长发育、响应非生物胁迫等方面发挥着重要的调控作用。为了进一步丰富丹参(Salvia miltiorrhiza)中该家族成员的研究,寻找新的参与调控丹参次生代谢产物合成相关的bHLH成员,本研究基于丹参转录组和基因组数据库,分别从cDNA和gDNA水平克隆获得SmbHLH37基因序列。该基因序列长1 506 bp,包含1个27 bp的内含子序列,1 479 bp完整的CDS(GenBank登录号:KP257470.1),编码492个氨基酸。Blast P分析结果显示,SmbHLH37与芝麻(Sesamum indicum)等植物的bHLH3同源性较高;SmbHLH37蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)bHLH转录因子家族的分子进化树结果显示,SmbHLH37与拟南芥bHLH转录因子At JAM3(A.thaliana jasmonate-associated MYC2-like3)亲缘关系最近。亚细胞定位结果显示,SmbHLH37蛋白主要定位在细胞核中。qRT-PCR分析结果显示,SmbHLH37在叶中的表达量最高,花中最低;用脱落酸(abscisic acid,ABA)和机械诱导处理后,该基因的表达短时间呈上调趋势;同时,SmbHLH37在Sm MYC2过表达株系OE-8和OE-12中的表达量显著上调(P0.05)。研究结果为进一步开展SmbHLH37功能研究提供了基础资料。
[Abstract]:Basic helix-loop-helixhlhh (basic helix-loop-helixhh) transcription factor family plays an important role in plant growth and development, response to abiotic stress, and so on. In order to further enrich the family members of Salvia miltiorrhizae and find new bHLH members involved in regulating the synthesis of secondary metabolites of Salvia miltiorrhizae, this study was based on the transcriptome and genomic database of Salvia miltiorrhizae. The sequence of SmbHLH37 gene was obtained from cDNA and gDNA. The gene sequence is 1 506bpand contains a 27bp intron sequence of 1 479bp complete CDS(GenBank accession number: KP257470.1, encoding 492 amino acids .Blast P analysis results show that SmbHLH37 has high bHLH3 homology with Arabidopsis thaliana and other plants such as Sesamum indicum. The molecular phylogenetic tree of Arabidopsis thaliana)bHLH transcription factor family showed that SmbHLH37 was closely related to Arabidopsis bHLH transcription factor at JAM3(A.thaliana jasmonate-associated MYC2-like 3. The results of subcellular localization showed that the SmbHLH37 protein was mainly located in the nucleus. QRT-PCR analysis showed that the expression of SmbHLH37 was the highest in the leaves and the lowest in the flower, and the expression of SmbHLH37 was up-regulated in a short time after abscisic acidmatine (ABA) and mechanical induction. At the same time, the expression of SmbHLH37 in Sm MYC2 overexpression lines OE-8 and OE-12 was significantly up-regulated (P0.05). The results provide basic data for further research on SmbHLH37 function.
【作者单位】: 陕西师范大学西北濒危药材资源开发国家工程实验室/药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室;
【基金】:国家自然科学基金项目(No.31670299)
【分类号】:Q943.2;S567.53
【相似文献】
相关期刊论文 前10条
1 李凤敏;李前忠;周欢敏;;小鼠蛋白质亚细胞定位预测[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2010年02期
2 李凤敏,李前忠;蛋白质亚细胞定位的识别[J];生物物理学报;2004年04期
3 张松;黄波;夏学峰;孙之荣;;蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究[J];生物化学与生物物理进展;2007年06期
4 赵禹;赵巨东;姚龙;;用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白质亚细胞定位[J];生物信息学;2010年03期
5 贾芸;吕军;赵巨东;杨小希;;蛋白质体积对其亚细胞定位的影响[J];氨基酸和生物资源;2013年03期
6 郑珊珊;石卓兴;代琦;姚玉华;;蛋白质亚细胞定位预测研究进展[J];科技视界;2014年12期
7 郑珊珊;石卓兴;代琦;姚玉华;;蛋白质亚细胞定位预测研究进展[J];科技视界;2014年15期
8 白雪源;马玉香;罗成华;师锁柱;侯剀;冯哲;傅博;陈香美;;人胆酸转运蛋白基因的克隆、亚细胞定位及其在肾组织中的表达[J];中国病理生理杂志;2008年02期
9 潘宇曦;喇玉娟;冯国鄞;贺林;;运用小波分析对蛋白质进行亚细胞定位预测(英文)[J];宁夏大学学报(自然科学版);2008年03期
10 张树波;赖剑煌;;蛋白质亚细胞定位预测的机器学习方法[J];计算机科学;2009年04期
相关会议论文 前6条
1 陈虎;孙之荣;;蛋白质亚细胞定位:数据整合和预测系统[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
2 黄淑云;孙兴玉;梁汝萍;邱建丁;;基于小波支持向量机预测蛋白质亚细胞定位研究[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
3 赵燕;张耀洲;童富淡;;家蚕HMGA的表达差异和亚细胞定位[A];全国动物生理生化第十二次学术交流会论文摘要汇编[C];2012年
4 张鹏;印莉萍;;水稻缺铁诱导高效表达基因OsNramp1的克隆、亚细胞定位及功能研究[A];中国植物生理学会第十次会员代表大会暨全国学术年会论文摘要汇编[C];2009年
5 邹永新;弭军;崔金鹏;张锡宇;李曦;郭辰虹;高贵敏;陈丙玺;龚瑶琴;;CUL4B表达及其亚细胞定位分析[A];中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编(2004-2008)[C];2008年
6 杨丹;张耀洲;;家蚕pBmHPC-21基因的克隆、表达及亚细胞定位[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2009年学术交流会论文摘要汇编[C];2009年
相关博士学位论文 前4条
1 曹隽U,
本文编号:1896872
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/1896872.html