荞麦属种间13S球蛋白基因序列比较研究

发布时间：2018-05-18 00:43

本文选题：荞麦 + S球蛋白基因　；参考：《植物遗传资源学报》2016年03期

【摘要】：荞麦13S球蛋白是荞麦种子中的一类主要贮藏蛋白。本研究选用荞麦属植物甜荞栽培种及其野生类型、苦荞栽培种及其野生类型、毛野荞、左贡野荞、细柄野荞和硬枝万年荞6个种共44份材料,进行PCR特异性扩增、测序得到荞麦13S球蛋白基因的保守片段序列。对序列进行差异分析,结果发现44份供试材料13S球蛋白基因片段的285个排列位点中不变位点为24个,多态性位点S为261个(含简约信息位点数198个和单型可变位点63个),序列总突变位点Eta为503个。野生甜荞种内13S球蛋白基因序列差异明显高于栽培甜荞,但野生苦荞种内13S球蛋白基因序列差异仅稍高于栽培苦荞。推测其一方面可能与繁殖方式有关,另一方面可能与荞麦驯化过程中通常只有少数野生型群体被驯化有关。系统聚类分析发现栽培甜荞与野甜荞亲缘关系近,与左贡野荞亲缘关系次之;栽培苦荞与野苦荞亲缘关系近,与毛野荞亲缘关系次之;细柄野荞和硬枝万年荞的13S蛋白基因片段序列差异较小,说明其亲缘关系较近。上述结果为荞麦属种间遗传多样性与进化关系研究提供了理论依据。
[Abstract]:Buckwheat 13s globulin is one of the main storage proteins in buckwheat seeds. In this study, 44 buckwheat species and wild types of buckwheat, Tartary buckwheat cultivated species and wild types, wild buckwheat, Zigong wild buckwheat, buckwheat with fine handle and buckwheat with hard branches were used to amplify the PCR specificity. The conserved fragment of the 13s globulin gene of buckwheat was sequenced. The sequence difference analysis showed that there were 24 invariant loci in 285 loci of the 13s globulin gene fragments of 44 tested materials. The number of polymorphic loci S was 261 (including 198 parsimonic information sites and 63 single variable loci), and the total number of mutation sites (Eta) was 503. The difference of 13s globulin gene sequence in wild buckwheat was significantly higher than that in cultivated buckwheat, but the difference of 13s globulin gene in wild Tartary buckwheat was only slightly higher than that in cultivated Tartary buckwheat. On the one hand, it may be related to breeding mode, on the other hand, it may be related to the domestication of only a few wild population during buckwheat acclimation. Systematic cluster analysis showed that the relationship between cultivated buckwheat and wild buckwheat was close, followed by Zigong wild buckwheat, cultivated Tartary buckwheat and wild buckwheat followed by wild buckwheat. The difference of 13s gene sequence between wild buckwheat and Wannian buckwheat was small, which indicated that the genetic relationship was close. These results provide a theoretical basis for the study of genetic diversity and evolutionary relationship between buckwheat species.
【作者单位】：贵州师范大学/荞麦产业技术研究中心;
【基金】：国家燕麦荞麦现代农业产业技术体系专项资金(CARS-08-A4) 国家自然科学基金项目(31471562、31171609) 贵州省高层次创新型人才培养对象十百千计划(2014GZ97588) 贵州省科技合作计划项目(黔科和LH[2015]7770号)
【分类号】：S517

【参考文献】

相关期刊论文前10条

1 史建强;李艳琴;张宗文;吴斌;王安虎;;荞麦及其野生种遗传多样性分析[J];植物遗传资源学报;2015年03期

2 郑殿升;杨庆文;;中国作物野生近缘植物资源[J];植物遗传资源学报;2014年01期

3 陈晴晴;石桃雄;陈庆富;;荞麦不同种间BW10KD过敏蛋白基因序列比较[J];广东农业科学;2013年09期

4 张以忠;陈庆富;;荞麦属种质资源发芽种子酯酶同工酶研究[J];广西植物;2011年02期

5 岳鹏;陈庆富;;植物种子蛋白的分子生物学研究进展[J];种子;2011年01期

6 高小丽;李芳;岳鹏;李天红;;欧李叶片全长cDNA文库的构建和部分克隆的序列分析[J];农业生物技术学报;2010年01期

7 赵佐成,周明德,王中仁,侯鑫;中国苦荞麦及其近缘种的遗传多样性研究[J];遗传学报;2002年08期

8 罗定泽,侯鑫,赵佐成;西南地区硬枝野荞麦(Fagopyrum urophyllum)居群的遗传多样性研究[J];武汉植物学研究;2001年02期

9 赵佐成,周明德,罗定泽,侯鑫,王中仁,沈国坤,李发良,曹吉祥;四川省凉山彝族自治州南部三县苦荞麦栽培居群的遗传多样性研究[J];遗传学报;2000年06期

10 王转花,马文丽;荞麦同工酶多态分析[J];山西农业科学;1998年02期

相关期刊论文前10条

1 魏恩慧;吴继红;刘冰;倪元颖;;魔芋葡甘聚糖的性质及在食品中的应用[J];食品工业;2016年05期

2 徐海明;;中国农业野生植物原生境保护实践研究[J];农业与技术;2016年08期

3 吴婕;韩丹;陈建欣;;普通荞麦生物技术研究进展[J];食品研究与开发;2016年07期

4 史建强;李艳琴;张宗文;吴斌;王安虎;;荞麦野生种的核型及进化特征分析[J];植物遗传资源学报;2016年03期

5 梁成刚;陈晴晴;石桃雄;陈其皎;孟子烨;陈庆富;;荞麦属种间13S球蛋白基因序列比较研究[J];植物遗传资源学报;2016年03期

6 胡亚妮;张宗文;吴斌;高佳;李艳琴;;基于ITS和ndhF-rpl32序列的荞麦种间亲缘关系分析[J];生物多样性;2016年03期

7 李荫藩;郑敏娜;梁秀芝;韩志顺;;苦荞种质资源生物学性状的多元统计分析与综合评价[J];中国农学通报;2016年06期

8 赖瑞联;薛辉康;钟春水;毛宇源;谢析颖;吕凯强;张梓浩;陈裕坤;林玉玲;赖钟雄;;闽江流域野生蕉(Musa itinerans)遗传多样性和遗传结构的ISSR分析[J];植物遗传资源学报;2016年02期

9 李小军;李淦;胡铁柱;胡喜贵;孙玉;茹振钢;宋杰;张立琳;;小麦—中间偃麦草衍生材料农艺性状、HMW-GS及GISH鉴定[J];植物遗传资源学报;2016年01期

10 邓琳琼;张以忠;;毕节市苦荞种质资源农艺性状的鉴定与评价[J];湖北农业科学;2015年15期

相关期刊论文前10条

1 田晓庆;徐宏亚;汪灿;阮仁武;袁晓辉;易泽林;刘光德;;用SSR标记分析荞麦栽培种资源的遗传多样性[J];作物杂志;2013年05期

2 郑殿升;李锡香;陈善春;高爱农;李立会;刘旭;;云南及周边地区野菜和野果资源[J];植物遗传资源学报;2013年06期

3 杜晓磊;张宗文;吴斌;李艳琴;王安虎;;苦荞SSR分子遗传图谱的构建及分析[J];中国农学通报;2013年21期

4 郑殿升;高爱农;李立会;刘旭;;云南及周边地区农作物野生近缘植物[J];植物遗传资源学报;2013年02期

5 杨庆文;秦文斌;张万霞;乔卫华;于寿娜;郭青;;中国农业野生植物原生境保护实践与未来研究方向[J];植物遗传资源学报;2013年01期

6 郑殿升;杨庆文;刘旭;;中国作物种质资源多样性[J];植物遗传资源学报;2011年04期

7 郑殿升;;中国燕麦的多样性[J];植物遗传资源学报;2010年03期

8 高小丽;李芳;岳鹏;李天红;;欧李叶片全长cDNA文库的构建和部分克隆的序列分析[J];农业生物技术学报;2010年01期

9 侯雅君;张宗文;吴斌;李艳琴;;苦荞种质资源AFLP标记遗传多样性分析[J];中国农业科学;2009年12期

10 任翠娟;陈庆富;;荞麦属(Fagopyrum Mill)植物资源的RAPD研究[J];种子;2009年11期

相关期刊论文前10条

1 杨坪;王安虎;马德华;刘坤香;徐芸涛;;冕宁县荞麦属植物环境特征分布分析[J];西昌学院学报(自然科学版);2006年04期

2 程t ;柏大全;邵继荣;罗庆林;唐宇;朱雪梅;何传云;;四川省阿坝州野生荞麦资源分布考察[J];西南农业学报;2009年01期

3 杨坪;李琨;阿支布洛;吴碧荣;;四川甘洛荞麦属植物生长特性及分布特征分析[J];江苏农业科学;2009年01期

4 唐文;周小理;吴颖;周一明;张美玲;;24种荞麦中矿物元素含量的比较分析[J];中国粮油学报;2010年05期

5 石桃雄;黎瑞源;郭菊卉;李月;李光;陈庆富;;基于微卫星标记普通荞麦种子序列表达标签的开发[J];贵州农业科学;2014年03期

6 李光;周永红;陈庆富;;荞麦基因工程育种研究进展[J];种子;2011年08期

7 华劲松;夏明忠;戴红燕;蔡光泽;;攀枝花市野生荞麦种质资源考察研究[J];现代农业科技;2007年09期

8 张以忠;李艳娟;邓琳琼;游萍;蹇黎;胥献宇;;荞麦过氧化物酶同工酶研究[J];种子;2011年02期

9 陈风雷;廖海民;李淑久;;荞麦子粒选择性败育的初步研究[J];湖北农业科学;2014年02期

10 王爱国;陈庆富;;荞麦属植物叶片及其愈伤组织中的总黄酮含量[J];贵州农业科学;2006年02期