阿特拉津降解菌Enterobacter sp.的基因差异分析

发布时间：2018-05-27 07:36

  本文选题：生物降解 + 阿特拉津　； 参考：《科学技术与工程》2017年27期

【摘要】：筛选并分析生物降解菌Enterobacter sp.在阿特拉津作用下的差异基因。以Enterobacter sp.BIDMC 29基因组为参考,利用高通量测序技术,对阿特拉津降解菌株和对照菌株进行转录组测序分析。结果表明,共有368个基因表现出显著差异,其中上调基因231个,下调基因137个。在差异基因GO富集分析的前30个条目中,尿嘧啶分解代谢、氮利用、硝酸盐同化、硫化氢生物合成、裂解酶活性和过氧化物酶活性等相关基因表现富集。Pathway分析显示,差异基因涉及70条代谢途径,与氮代谢、氨基酸合成和代谢、ABC转运蛋白、丙酮酸代谢等过程有关。菌株通过调节基因表达来提高对阿特拉津的降解能力,为进一步解析阿特拉津的代谢机制奠定基础。
[Abstract]:Screening and analysis of biodegradable bacteria Enterobacter sp. Differentially expressed genes in the presence of atrazine. The transcriptome sequencing of atrazine degrading strain and control strain was carried out by high throughput sequencing with Enterobacter sp.BIDMC 29 genome as reference. The results showed that 368 genes showed significant differences, including 231 up-regulated genes and 137 down-regulated genes. Among the first 30 items in differential gene go enrichment analysis, uracil catabolism, nitrogen utilization, nitrate assimilation, hydrogen sulfide biosynthesis, lyase activity and peroxidase activity showed enrichment. Differentially expressed genes involve 70 metabolic pathways related to nitrogen metabolism amino acid synthesis and metabolism of ABC transporter and pyruvate metabolism. The strain could improve the degradation ability of atrazine by regulating gene expression and lay a foundation for further analysis of atrazine metabolism mechanism.
【作者单位】： 沈阳化工大学环境与安全工程学院;
【基金】：国家自然科学基金(31400481) 辽宁省博士科研启动项目(20141086)资助
【分类号】：X172

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本文编号：1941088