八肋游仆虫胞质核糖体蛋白基因序列特征分析
本文选题:八肋游仆虫 + 核糖体蛋白 ; 参考:《水生生物学报》2017年03期
【摘要】:为了探讨八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)核糖体蛋白基因的数目及其结构的特殊性,研究通过生物信息学方法,对八肋游仆虫胞质核糖体蛋白进行了系统的分析。共鉴定得到98个基因编码78种不同的胞质核糖体蛋白。其中19种胞质核糖体蛋白基因发生了复制,尽管都是有功能的,但其中一个基因的表达受到限制。通过与高等真核生物比较,我们发现:八肋游仆虫核糖体蛋白eS30缺失了N端的类泛素结构域,eL6缺失了N端的Ribosomal_L6e_N结构域。另外,不同于其他高等真核生物,八肋游仆虫酸性核糖体磷酸化蛋白uL 10为碱性蛋白。研究为进一步探讨低等真核生物核糖体的组装及功能奠定了基础。
[Abstract]:In order to study the number and structural particularity of ribosomal protein gene of Euplotes octocarinatus, the cytoplasmic ribosomal protein of Euplotes octocarinatus was systematically analyzed by bioinformatics. A total of 98 genes were identified to encode 78 different cytoplasmic ribosomal proteins. Nineteen cytoplasmic ribosomal protein genes were duplicated, although all were functional, but the expression of one of them was restricted. In comparison with higher eukaryotes, we found that the N-terminal ubiquitin domain of the ribosomal protein eS30 and the N-terminal Ribosomals-L6eN domain were found to be missing. In addition, the acidic ribosomal phosphorylation protein UL10 is a basic protein, which is different from other higher eukaryotes. The study laid a foundation for further study on the assembly and function of low eukaryote ribosomes.
【作者单位】: 山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室;
【基金】:国家自然科学基金(31071924和31372199)资助~~
【分类号】:Q78
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,本文编号:2005074
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