发菜固氮酶nifH基因克隆及其干旱胁迫下的差异表达
本文选题:发菜 + 固氮酶 ; 参考:《西北农业学报》2017年11期
【摘要】:通过对发菜固氮酶H亚基基因(nifH)全长进行克隆、原核表达和生物信息学分析,采用qRT-PCR技术,分析不同干旱胁迫下发菜固氮酶基因nifH在转录水平的表达变化。结果表明,根据特异性引物克隆获得长度为894bp的nifH,GenBank登陆号为BankIt1901364(KU886163)。将nifH在大肠杆菌中表达,获得约36ku的外源蛋白。生物信息学分析表明,发菜nifH与已报道的多种蓝藻的nifH及推导的氨基酸序列具有较高的相似性,nifH二级结构和三级结构主要由α螺旋、β-折叠、随机卷曲和β-转角构成。随藻体含水量的逐渐降低,发菜nifH在转录水平上的表达量逐渐增加,固氮酶活性呈现先增加后下降的趋势。研究结果为进一步研究发菜固氮酶基因的分子结构和发菜响应干旱胁迫的固氮机制及氮代谢过程奠定基础。
[Abstract]:The full length of nitrogenase H subunit (NIF H) was cloned, prokaryotic expression and bioinformatics analysis were used to analyze the expression of nifH at transcription level under different drought stress. The results showed that the accession number of 894bp was BankIt1901364 and KU886163. NifH was expressed in Escherichia coli and the foreign protein of about 36ku was obtained. Bioinformatics analysis showed that nifH and deduced amino acid sequences of nifH and other reported cyanobacteria had high similarity. The secondary and tertiary structures of nifH were mainly composed of 伪 helix, 尾 -fold, random crimp and 尾 -rotation angle. With the decrease of water content in algae, the expression of nifH increased at the transcriptional level, and the activity of nitrogenase increased first and then decreased. The results laid a foundation for further study on the molecular structure of the nitrogenase gene and the mechanism of nitrogen fixation and nitrogen metabolism in lettuce in response to drought stress.
【作者单位】: 宁夏大学生命科学学院;
【基金】:宁夏自然科学基金(NZ1608)~~
【分类号】:Q943.2
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,本文编号:2012904
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