IGFBP家族基因和LOC106047490基因与肥肝鹅生产性能的关系

发布时间：2018-06-19 04:46

本文选题：遗传标记 + IGFBP　；参考：《扬州大学》2017年硕士论文

【摘要】：鹅肥肝既是重要的水禽产品,也是独特的非酒精性脂肪肝研究模型。发现与鹅肥肝形成相关的关键候选基因,揭示它们与鹅肥肝形成的关系,不仅可以促进鹅肥肝形成机制的阐明,而且有助于肝用鹅的分子育种。当一个基因的表达量或其核酸多态性标记(如SNP)与肥肝鹅的生产性能存在关联时,该基因或可用作辅助选择标记来提高肥肝鹅的育种效率,克服目前肥肝鹅育种存在的问题。本研究对IGFBP家族基因和一个长非编码RNA基因(LOC106047490)的表达量进行测定,并对这些基因所含SNP位点与肥肝鹅的生产性能进行关联分析。具体的研究方法和结果如下:1.利用荧光定量PCR检测填饲19天朗德鹅和对照鹅肝脏中IGFBP家族基因的表达。数据表明,相对于正常肝脏,鹅肥肝中IGFBP1、IGFBP2和IGFBP5的表达受到明显抑制。该结果提示这三个基因与鹅肥肝的形成密切相关,它们的表达量或可用于肥肝鹅生产性能的预测。2.对IGFBP1、IGFBP2和IGFBP5基因及上游DNA区域(起始密码子上游2kb)进行引物设计,检测这些基因SNP位点,并分析SNP位点与填饲鹅生产性能指标(如肝重、腹脂重和胴体重等)的关联。对于SNP位点的筛查,首先利用10只朗德鹅和10只扬州鹅查找品种间的SNP位点,然后扩大样本量检测朗德鹅特有的SNP位点。结果显示:①对于IGFBP1基因,扬州鹅品种内有7个SNP,朗德鹅品种内未发现SNP,而朗德鹅和扬州鹅品种间共有12个SNP;②对于IGFBP2基因,扬州鹅品种内有13个SNP,朗德鹅品种内有1个SNP,而两个品种间共存在49个SNP。统计分析表明朗德鹅品种内的SNP位点与腹脂重呈显著相关(p0.01);③对于IGFBP5,扬州鹅品种内有10个SNP,朗德鹅品种内特有3个SNP,而朗德鹅和扬州鹅品种间共存在19个SNP。统计分析表明朗德鹅品种内的两个SNP位点与肥肝重呈显著相关(p0.01)。这些发现从关联分析的角度进一步证实了这些基因作为肝用鹅育种辅助选择标记的应用价值。3.NCBI数据库中IGFBP2基因上游距离起始密码子1602bp处存在部分序列未知,本研究通过基因特异性PCR扩增获得了这段367bp长的序列。4.利用荧光定量PCR检测1ncRNA基因(LOC106047490)在鹅不同填饲期(7天、14天及19天)肝脏、腹脂和胸肌中的表达量。结果表明,填饲可以抑制该基因在三个组织中的表达,且随着填饲时间的延长,该基因在肝脏和胸肌中的表达量下调更加明显,这可能与组织中脂肪的沉积量有关。该发现提示该长非编码RNA基因的表达量或可预测肥肝鹅组织中的脂肪沉积量。5.为进一步明确该基因与鹅肥肝形成的关系,本研究利用荧光定量PCR检测了 1ncRNA基因(LOC106047490)在不同脂肪肝形成相关因子(葡萄糖、胰岛素、棕榈酸、油酸和亚油酸)处理下鹅原代肝细胞中的表达情况。结果发现,除棕榈酸外,其他因子均能诱导该基因的表达,且这种诱导具有一定的剂量效应。这种诱导与鹅肥肝中的表达抑制不一致,提示鹅肥肝形成中还存在着其他更重要的因子调控该基因的表达。6.为进一步探讨该基因作为辅助选择标记的应用价值,本研究分析了该基因表达的组织特异性,利用荧光定量PCR对该基因在23日胚龄和89日龄鹅的不同组织中表达量进行测定。结果发现,在鹅胚胎期LOC106047490基因在肝脏和腿肌中表达量较低,而在心、胸肌、肠和肌胃中的表达量较高;而在89日龄鹅,该基因在腹脂中的表达量最高。此外,通过不同时期同类组织中该基因表达量的比较,可以发现该基因的表达模式受鹅生长时间的影响。这些结果为该基因用于鹅育种中的辅助选择提供了参考信息。7.对朗德鹅和扬州鹅LOC106047490基因的外显子区进行SNP分析,在扬州鹅品种内发现12个SNP位点,而在朗德鹅品种内未发现SNP位点。综上所述,本研究发现IGFBP家族基因和长非编码RNA基因(LOC106047490)均与鹅肥肝的形成密切关联,是肥肝鹅辅助选择标记的重要候选基因。进一步开发利用这些基因,将有助于肥肝鹅育种中现有问题的解决。
[Abstract]:The expression of IGFBP1 , IGFBP2 , IGFBP5 and IGFBP5 in goose liver was studied . The results showed that the expression of the gene was higher in the liver and the leg muscle than the palmitic acid . The results showed that the expression of the gene was higher in the liver and the leg muscle than the palmitic acid .
【学位授予单位】：扬州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S835

【参考文献】