广西地方稻种资源核心种质红色种皮全基因组关联分析及鉴定两个新的Rc等位基因

发布时间：2018-07-01 19:21

  本文选题：水稻 + 红色种皮　； 参考：《分子植物育种》2017年01期

【摘要】：稻米种皮颜色可以分为白、红、黑等。在红色稻米种皮中富含原花青素,其具有抗氧化活性,有利于人体健康。本研究以419份广西地方稻种资源核心种质为实验材料,利用全基因组关联分析验证了控制水稻红色种皮的基因Rc。利用In Del标记HM1对97份红色种皮材料的DNA进行PCR,发现C323和C139属于第7外显子有14 bp缺失的红色种皮品种。然后,我们利用Sanger测序技术对这两个自然突变品种的Rc基因进行外显子测序,分析结果表明Rc ~(C139)和Rc ~(C323)属于2种不同的Rc等位基因类型。
[Abstract]:Rice seed coat color can be divided into white, red, black and so on. The red rice seed coat is rich in proanthocyanidins and has antioxidant activity, which is beneficial to human health. In this study, 419 core germplasm of Guangxi local rice resources were used as experimental materials, and the gene Rc controlling the red seed coat of rice was verified by whole genome association analysis. In Del labeled HM1 was used for PCR-based DNA analysis of 97 red seed coat materials. It was found that C323 and C139 were red seed coat varieties with 14 BP deletion at exon 7. Then, we used Sanger sequencing technique to sequence the RC gene of these two natural mutants. The results showed that RC ~ (139) and RC ~ (C323) belonged to two different types of RC alleles.
【作者单位】： 广西农业科学院水稻研究所广西水稻遗传育种重点实验室;
【基金】：广西自然科学基金(2015GXNSFBA139080) 广西科学计划与研究项目(桂科AB16380117) 广西农业科学院优势团队项目(2015YT15);广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2016YM29;桂农科2016JM09)共同资助
【分类号】：S511;Q943.2

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本文编号：2088880