牦牛AP-1基因的克隆及蛋白质结构分析
本文选题:AP-基因 + 麦洼牦牛 ; 参考:《黑龙江畜牧兽医》2017年03期
【摘要】:为了探讨牦牛AP-1基因的生理功能与结构,试验采用RT-PCR方法克隆牦牛AP-1基因,并且用多种生物信息学软件分析基因序列。结果表明:获得麦洼牦牛AP-1基因长496 bp,包含1个475 bp的开放阅读框,编码158个氨基酸。系统进化树结果显示,麦洼牦牛AP-1序列与野牦牛亲缘关系最近。AP-1编码蛋白质的相对分子质量为18.62 ku,理论等电点为5.20,不含跨膜区,不存在信号肽,二级结构以α-螺旋为主。该基因的三级结构与人AP-1蛋白质相似度高达98.05%。
[Abstract]:In order to study the physiological function and structure of Yak AP-1 gene, the Yak AP-1 gene was cloned by RT-PCR, and the gene sequence was analyzed by a variety of bioinformatics software. The results showed that the AP-1 gene of Mai WA Yak was 496 BP long and contained a 475 BP open reading frame encoding 158 amino acids. The results of phylogenetic tree showed that AP-1 sequence of Mai WA Yak had the closest phylogenetic relationship with wild yak. The relative molecular weight of protein encoded by AP-1 was 18.62 ku. the theoretical isoelectric point was 5.20. There was no transmembrane region and no signal peptide. The secondary structure was 伪 -helix. The tertiary structure of the gene is similar to that of human AP-1 protein as high as 98.05.
【作者单位】: 西南民族大学生命科学与技术学院;西南民族大学青藏高原研究院;
【基金】:中央高校青年教师资金项目(2015NZYQN60) 四川省教育厅重点项目(16ZA0014)
【分类号】:S823.85
【参考文献】
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【共引文献】
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本文编号:2103940
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