绵羊卵巢PSP94基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-07-13 15:25

【摘要】：本研究克隆绵羊卵巢微精蛋白β(PSP94)基因,旨在预测其编码蛋白的结构与功能。以河北小尾寒羊作为试验动物,提取卵巢组织RNA,采用RT-PCR和pMD19-T载体,克隆测序得到PSP94基因序列,结合生物信息学方法分析其生物学特性。结果表明,绵羊发情期和间情期卵巢中均有PSP94基因表达,克隆得到的绵羊PSP94长度为462 bp,开放阅读框(ORF)长度为336 bp,编码111个氨基酸,系统聚类分析图分析表明绵羊与牛遗传距离较近;生物信息学预测显示,该蛋白属于稳定酸性亲水蛋白,有5个磷酸化位点和2个N-糖基化位点,亚细胞定位于胞外,属于分泌蛋白,N端有信号肽,没有跨膜结构域。蛋白质二级结构主要结构元件是α-螺旋、延伸链和不规则卷曲。
[Abstract]:This study cloned the ovine ovarian sperm protein beta (PSP94) gene to predict the structure and function of its encoded protein. Taking Hebei Small Tail Han sheep as an experimental animal, extracting RNA of ovarian tissue, using RT-PCR and pMD19-T vectors, cloning and sequencing the sequence of PSP94 gene and analyzing its biological characteristics with bioinformatics methods. The results showed that sheep PSP94 gene expression was found in the oestrus and estrous ovary. The length of sheep PSP94 was 462 BP, the length of the open reading frame (ORF) was 336 BP, and 111 amino acids were encoded. The genetic distance between sheep and cattle was closer to the sheep and cattle. The bioinformatics prediction showed that the protein belonged to the stable acid hydrophilic protein and 5 phosphoric acid. The loci and 2 N- glycosylation sites are located outside the cell, belonging to the secretory protein, the N terminal has a signal peptide and no transmembrane domain. The main structural elements of the protein two structure are alpha helix, extended chain and irregular curl.
【作者单位】： 河北农业大学动物科技学院;河北科技师范学院动物科技学院;
【基金】：河北省高等学校科学技术研究青年基金项目(QN2015162) 河北省首批青年拔尖人才支持计划(2016-2018)
【分类号】：S826

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本文编号：2119876