白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-07-18 16:02

【摘要】：为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 k D。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。
[Abstract]:In order to understand the structural characteristics of squalene synthase gene needed for cucurbitacin biosynthesis pathway in Cucurbitaceae, the squalene synthase (SS) gene was cloned and analyzed by bioinformatics. According to the cDNA sequences of squalene synthase genes of gynostemma pentaphyllum, Luohanguo and Trichosanthes kirilowii, the squalene synthase primers were designed. The squalene synthase 3 'and 5' end of squalene synthase gene were amplified by using 3 'race and 5' race techniques, respectively. Two cDNA clones of squalene synthase gene of Cucumber, CsSS1 and CsSS2, were obtained. The cDNA sequences were 1 627 BP and 1 534 BP, respectively, encoding 417 amino acid residues with molecular weight of 47.6 KD. The full-length cDNA sequence of squalene synthase gene was cloned and sequenced, which can be used to analyze the function of squalene synthase gene in cucurbitacin biosynthesis pathway.
【作者单位】： 广西医科大学生物化学与分子生物学教研室;广西高校生物分子医学研究重点实验室;广东医学院药学院;桂林医学院;
【基金】：国家自然科学基金(No.31260069) 广西高等学校科研项目(No.201203YB038)共同资助
【分类号】：Q943.2

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本文编号：2132419