基因表达分析稻瘟病菌中8个假定RhoGAP蛋白与几丁质合酶的关系

发布时间：2018-08-31 12:16

【摘要】：通过分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对Rho GAP家族进行序列分析,运用RT-PCR技术获得了该家族基因的部分c DNA序列,通过实时荧光定量技术分析Rho GAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个Rho GAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个Rho GTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同Rho GAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明Rho GAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究Rho GAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。
[Abstract]:The effect of Rho GAP family gene on cell wall formation was studied by analyzing the relationship between the gene expression of Rho GAP family and chitinase family gene. The Rho GAP family was sequenced by using different bioinformatics software. The partial c DNA sequence of the family gene was obtained by RT-PCR technique. The relationship between Rho GAP gene and chitinase gene was analyzed by real-time fluorescence quantitative technique. The results showed that 8 Rho GAP genes contained conserved GAP domain in rice blast pathogen database and were water-soluble proteins with relatively large molecular weight. Phylogenetic analysis showed that 16 Rho GTP activator proteins could be classified into two groups. Different chitinase genes were expressed in different Rho GAP gene mutants, and the general trend was up-regulated. The results suggested that Rho GAP gene family proteins might be involved in cell wall synthesis in different stages of rice blast fungus, which laid a foundation for further study on the metabolic pathway of Rho GAP family genes involved in diversity.
【作者单位】： 福建农林大学生命学院;福建农林大学植物保护学院;中国热带农业科学院椰子研究所;
【基金】：国家自然科学基金(31500118,31571943)资助
【分类号】：S435.111.41

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