水稻microRNA及其靶基因的系统鉴定

发布时间：2018-10-22 12:28

【摘要】：microRNA(miRNA)在植物生长发育和环境胁迫中发挥着重要的作用.本研究基于49个水稻小RNA测序数据,系统分析了已知miRNA的表达,并鉴定到了新的水稻miRNA.研究发现,miRBase上注释的水稻miRNA中,只有39%具有可检测的表达.此外,对水稻降解组数据的分析鉴定到一些新的miRNA靶基因,包括2个新的miR444靶基因,它们分别编码WD40蛋白和热休克因子型DNA结合蛋白.
[Abstract]:MicroRNA (miRNA) plays an important role in plant growth and environmental stress. In this study, based on 49 rice small RNA sequencing data, the expression of known miRNA was analyzed systematically, and a new rice miRNA. was identified. Only 39% of rice miRNA annotated on miRBase had detectable expression. In addition, some new miRNA target genes, including two new miR444 target genes, encoding WD40 protein and heat shock factor type DNA binding protein, were identified by analyzing the degradation data of rice.
【作者单位】： 深圳大学生命与海洋科学学院广东省植物表观遗传学重点实验室;中国科学院遗传与发育生物学研究所;
【基金】：国家自然科学基金项目(31571332,31210103901,91440105)
【分类号】：Q943.2

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本文编号：2287159