羊草不同组织实时定量PCR内参基因的筛选

发布时间：2018-10-30 08:36

【摘要】：为筛选羊草(Leymus chinensis)不同组织实时定量PCR(qRT-PCR)试验体系中的最佳内参基因,以羊草叶、茎、根、穗为研究材料,利用qRT-PCR技术分析TUA、TUB、18SrRNA、EF-1α、APRT、CYP、Actin和CBP20共8个常用候选管家基因的表达情况,并使用geNorm和NormFinder软件进行综合评价,以期筛选出羊草不同组织中最稳定的内参基因。结果表明,8个候选内参基因在羊草不同组织表达稳定性不同,其中,叶片中稳定性较高的内参基因是Actin;茎中稳定性较高的内参基因是EF-1a;根中稳定性较高的内参基因是APRT和18SrRNA;穗中稳定性较高的内参基因是TUB。本研究结果将为开展羊草功能基因的表达分析提供重要参考。
[Abstract]:In order to screen the best internal reference genes in the real-time quantitative PCR (qRT-PCR) test system for different tissues of Leymus chinensis, the leaf, stem, root and ear of Leymus chinensis were used as the research materials. TUA,TUB,18SrRNA,EF-1 伪 and APRT,CYP, were analyzed by qRT-PCR technique. The expression of 8 common candidate housekeeping genes in Actin and CBP20 was evaluated by geNorm and NormFinder software in order to screen the most stable internal reference genes in different tissues of Leymus chinensis. The results showed that the stability of the eight candidate internal reference genes was different in different tissues of Leymus chinensis, and the stable internal reference gene in leaf was EF-1a; in the stem of Actin;. APRT and 18s rRNA are the most stable genes in root and TUB. is the most stable gene in ear. The results of this study will provide an important reference for the expression analysis of functional genes in Leymus chinensis.
【作者单位】： 中国农业科学院草原研究所;中国农业科学院研究生院;内蒙古农业大学生命科学学院;
【基金】：国家重点基础研究计划973项目(2014CB138804) 国家自然科学基金(31502008) 中央级公益性科研院所基本科研业务费
【分类号】：Q943.2;S543.9

【参考文献】

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